同工異源酶

同工異源酶是指來源不同但能識別和切割同一位點的限制性內切酶，也稱同裂酶。不過有些同工異源酶對於切割位點上的甲基化鹼基的敏感程度有所不同，如HapⅡ和MspⅠ是一對同工異源酶，它們共同的靶序列為CCGG。

當序列中出現一個甲基化的胞嘧啶時（CC*GG），HapⅡ就不能夠切割它，而MspⅠ則不受影響。這樣的細微差異可以用來研究DNA的甲基化作用。