制約工程系下設藥學原理和制約技術兩個教研室。
製藥工程系現有專職教師11名，分別來自中國醫學科學院&中國協和醫科大學、吉林大學、吉林農業大學、江南大學等院校；教授1人，副教授4人，講師6人；具有博士學位的教師8人，碩士學位教師3人。
積極參與了2010版新的專業培養方案的修訂，積極探索生物製藥類課程的教法研究，總結出一套較為實用的教學模式和方法並在實際授課中得到了套用。由本系教師承擔的《免疫學》、《製藥工藝學》課程被評為學校教學模式與方法改革示範課程；《現代提取分離技術》課程被評為省級優秀課程。
制約工程系,設施配備,
制約工程系
本系教師已參與編寫了校內外主持編寫的一系列規劃教材，主編參編教材、專著5部，在編教材2部；同時承擔省、校教學研究與教學改革項目10項，重點項目3項。共發表20餘篇教學研究論文。本系教師近幾年承擔國家級、省市廳級、校科研項目20餘項，吉林省科技進步二等獎3項、三等獎2項，在國內外核心刊物上發表論文60餘篇，其中SCI 收錄10篇；已授權發明專利3項。
重視實踐教學環節，不斷的對製藥工程系相關實驗室進行建設，並擁有生物反應器與藥物開發教育部工程研究中心、農業部地方共建農業生物技術與生物資源研究中心、農業部參茸產品質量監督檢驗測試中心，農業生物學與工程技術實驗教學示範中心等實驗平台。同時通過與企業溝通合作的方式，使學生走出校門，進入生產一線，更加直觀地了解製藥發展動態。實踐教學的內容主要包括：實驗課、基本技能訓練、教學實習、生產實習、畢業設計和公益勞動等環節。
設施配備
製藥工程系相關實驗室總面積為2500 m2。設備儀器台（套）數499台（總價值877萬元），儀器設備完好率為98%；儀器設備利用率94%；實驗課開出率達100%。實驗室承擔藥物化學、製藥工藝學、免疫學、細胞生物學、藥劑學、生物化學等十餘門實驗課的教學任務。開設了生物技術製藥、GMP認證、製藥工藝學、製藥設備等多門實習課程。
