反式肽單元

絕大多數肽單元連續的Cα原子處於連結它們的肽鏈的相反方向，稱為反式肽單元（trans peptide unit)。由於空間干擾的原因，少部分可形成順式肽單元（cis-peptide unit)，蛋白質中腦氨酸殘基有時形成順式膚單元。由於順式肽單元肽鍵能量高，故不如反式肽單元穩定。

20世紀30年代末L.Pauling和R.B.Corey套用X衍射技術技術研究胺基酸和寡態晶體結構，其目的是要獲得一組標準鍵長和鍵角，以推導肽的構象，最終提出了肽單元（peptide unit)的概念。他們參與肽鍵的6個原子Ca1,C,O,N,H和Ca2（Ca1中的a1是“阿法”1下標，我打不出來，同樣Ca2也是）位於同一平面。Ca1和Ca2在平面上所處的位置為反式構型，此同一平面上的6個原子構成了所謂的肽單元。其中肽鍵（C-N）的鍵長為0.132nm，介於C-N的單鍵長（0.149nm）和雙鍵長(0.127nm）之間，所以有一定程度雙鍵性能，不能自由旋轉。而Ca分別與N和CO相連的鍵都是典型的單鍵，可以自由旋轉。