南京工程學院數理部是南京工程學院主管的機構，於2000年由“南京機械高等專科學校”、“南京電力高等專科學校”以及“核工業部南京工業學校”三校的基礎部合併組建而成。
2012年11月學校機構調整，基礎部更名為數理部。下設套用數學教研室、高等數學教研室、數學培訓中心、大學物理教研室及物理實驗中心。主要承擔學校全日制本科含民辦康尼學院及成人本專科學生的高等數學、機率論與數理統計、積分變換、複變函數、大學物理、大學物理實驗等基礎教學課程。
南京工程學院數理部現有教職工75人，其中教授9人，副教授24人，講師38人；博士21人（含在讀），碩士40人。擁有江蘇省“優秀科技工作者”、江蘇省“五一勞動獎章”獲得者、“省333高層次人才培養工程”首批中青年科學技術帶頭人、校教學名師、優秀中青年學術骨幹教師多人。形成了老、中、青相結合以優秀中青年教師為主體的教師隊伍。多名青年教師在省高校基礎課授課競賽中獲獎，蟬聯多屆校青年教師講課競賽一等獎。
近年來數理部科研能力不斷增強、教學水平不斷提高，編寫出版了《高等數學》、《線性代數》、《複變函數與積分變換》、《大學物理》、《大學物理實驗》等教材，發表論文140餘篇，其中核心期刊60餘篇，被EI、SCI、ISTP收錄75篇。申請主持了國家自然科學基金、國家數學天元基金，江蘇省科技廳基礎研究基金、省教育廳自然科學基金等多項。努力把數理部建設成為教學效果優良、管理規範的基礎教學院系。
