功能等位性

功能等位性是建立一種基於等位基因特異性PCR原理的改良SNP分型新方法。

介紹

建立一種基於等位基因特異性PCR原理的改良SNP分型新方法：片段長度差異等位基因特異性PCR，並考察特異性引物的3'端第3位、第4位鹼基錯配對特異性延伸的影響。方法　以SNP位點rs759117和rs760887為例，設計兩條長度不同、3'末端分別與SNP兩個等位基因鹼基配對的上游引物，同時在兩個等位基因特異性引物3'端第3或第4位鹼基引入錯配以增加特異性，下游為公用引物。PCR產物經聚丙烯醯胺凝膠電泳、銀染顯帶後確定樣本的基因型。結果　不同SNP純合子為長度不同的單一譜帶，雜合子則為兩條帶，其結果與直接測序完全一致。兩條特異性上游引物3'端第3或第4位鹼基引入錯配後非特異性延伸顯著減少，且對PCR反應條件的嚴格性要求明顯降低。結論　片段長度差異等位基因特異性PCR是一種簡單快速而有效的SNP分型新方法；兩條特異性引物3'端第3、第4位鹼基引入錯配可使特異性顯著增加。

相關資料

甘藍型油菜8Z05和青油10號為硼高效品種;Bakow為硼低效品種.2000～2001年度,硼高效品種8Z05×青油10號F2代588個單株種植在缺硼土壤上.花期調查缺硼症狀,表現硼高效的單株數與硼低效的單株數之比為574∶14;結實期分離規律與花期相似.這說明甘藍型油菜硼高效品種8Z05和青油10號硼營養高效主效基因是等位的,同時可能存在微效基因的修飾作用,但微效基因的QTL可能不完全相同.2個年度的試驗結果一致.

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http://scholar.ilib.cn/A-zwyyyflxb200302017.html