內蒙古自治區人民檢察院案件管理辦公室是內蒙古自治區人民檢察院內設機構。負責案件的統一受理流轉、辦案流程監控、涉案財物的監管、法律文書監管、案件信息公開,履行對案件的管理監督職能。統一組織辦案質量評查、業務考評和業務統計分析研判。組織指導人民監督員工作。負責業務信息化需求統籌,指導全區檢察機關統一業務套用系統的套用。