內源性質粒pMF1存在機制及其對粘球菌宿主進化的影響

《內源性質粒pMF1存在機制及其對粘球菌宿主進化的影響》是依託山東大學,由李越中擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:內源性質粒pMF1存在機制及其對粘球菌宿主進化的影響
  • 項目類別:面上項目
  • 項目負責人:李越中
  • 依託單位:山東大學
中文摘要,結題摘要,

中文摘要

粘細菌是具有複雜群體細胞行為和大基因組特徵的細菌類群。pMF1是到目前為止發現的唯一能在粘細菌細胞中穩定存在的內源性質粒。我們在前期工作基礎上,完成了發現質粒的菌- - 橙色粘球菌(Myxococcus fulvus)124B02的全基因組測序。該菌基因組顯著大於其他已測序的粘球菌。為研究pMF1的存在機制及其對粘細菌宿主進化的影響,我們從124B02中消除了pMF1,並設定不同實驗組進行人工進化實驗。結果顯示,隨著培養條件的不同,質粒表現出差異的穩定性,並顯著影響宿主細胞的表型變化。本申請擬對人工進化菌株進行基因組重測序,尋找突變基因;通過遺傳學實驗驗證關鍵基因;並開展關鍵基因的功能分析。研究結果對認識粘細菌複雜生活方式和大基因組的形成有重要意義,並為研究細菌宿主與內源性低拷貝質粒的共同進化模式提供參考。

結題摘要

pMF1是我們前期發現的粘細菌內源性質粒,是到目前為止發現的唯一能在粘細菌細胞中穩定存在的質粒。在本項目中,(1)我們完成了發現該質粒的菌株-橙色粘球菌124B02的全基因組測序,並進行了基因組橫向分析,嘗試從組學層面上解析pMF1存在於124B02中的機制;(2)為研究pMF1的存在機制及其對粘細菌宿主進化的影響,我們從124B02中消除了pMF1,並設定不同實驗組進行人工進化實驗。結果表明,pMF1質粒的存在具有條件依賴性,重測序結果說明124B02/pMF1菌株的基因組變異的整體趨勢在正常範圍,而124B02/free菌株基因組突變率發生了異常的增高;(3)我們證明pMF1.19和pMF1.20是一對核酸酶毒素-免疫蛋白,以後分離自殺的方式在質粒穩定遺傳中發揮作用——結合我們之前對pMF1質粒中複製和分配系統的研究結果,可以確定多種質粒維持機制共同幫助這個低拷貝質粒提高穩定性;(4)以純化後的ParA進行pulldown和western檢測結果發現,ParA能夠釣取ParC;結構模建顯示,ParA能夠形成同源二聚體,並藉助ParC 蛋白中介,形成ParA-ParA-ParC-ParA-ParA 排列的五聚體,通過ParA同源二聚體和ParC蛋白的交替結合,可以產生細長的纖維絲結構來介導pMF1質粒的分配。

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