免疫組學的概念最早是在1999年由Pederson教授在奧斯陸舉行的自身免疫國際會議上提出的,但當時Pederson教授的免疫組學的定義只局限於研究抗體和TCR V區分子結構與功能,隨著人類基因組計畫的完成,免疫組學的概念已遠遠超出了抗體和TCR的範疇,其新定義是研究免疫相關的全套分子庫,它們的作用靶分子及其功能,免疫組學包括了免疫基因組學,免疫蛋白質組學和免疫信息學三方面的研究,特彆強調在基因組學和蛋白質組學研究的基礎上,充分利用生物信息學,生物晶片,系統生物學,結構生物學,高通量篩選等技術。