保亭黎族苗族自治縣林業局內設辦公室、林政股、營林股、森林植物病蟲害檢疫站、野生動物保護站、森林防火辦公室、森林公園管理辦公室、綠化委員會辦公室、林業工作總站、種苗站等10個股級機構。
負責會議組織,秘書事務、文電處理、財務報賬、信息綜合、文書檔案及日常行政管理工作;負責紀檢監察,組織人事和黨群工作;負責全縣林業系統管理和統計工作。
(二)林政股
負責保護全縣森林資源,正確執行國家及省有關林業法律法規,嚴厲打擊破壞森林資源,破壞生態環境的行為。
(三)營林股
負責全縣人工林的營造工作,組織技術人員進行造林規劃、設計、技術指導以及檢查驗收,確保森林覆蓋率的不斷提高。
(四)森林植物病蟲害檢疫站
負責全縣森林病蟲害的監測、檢疫及防治工作。
(五)野生動物保護站
負責全縣野生動物的保護工作,打擊亂捕濫殺野生動物的違法犯罪活動。
(六)森林防火辦公室
負責全縣森林火災的預防、監測和組織撲救工作,防止森林資源遭受火災破壞。
(七)森林公園管理辦公室
負責我縣七仙嶺溫泉國家森林公園的規劃、保護、建設和管理工作。
(八)綠化委員會辦公室
負責全縣的造林綠化工作,貫徹實施義務植樹實施辦法,制定義務植樹的規劃方案和組織實施,徵收綠化費。
(九)林業工作總站
負責全縣各鄉鎮林業工作站、護林站、木材檢查站的管理、指導和監督工作。協助鄉鎮政府做好造林、護林工作。
(十)種苗站
負責林木種苗的培育管理以及種子、種苗的檢驗檢疫工作。