《中國酸性土壤假諾卡氏菌科資源與系統分類研究》是依託北京理工大學，由張建麗擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：中國酸性土壤假諾卡氏菌科資源與系統分類研究
- 依託單位：北京理工大學
- 項目負責人：張建麗
- 項目類別：面上項目
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
假諾卡氏菌科許多成員能產生生物活性物質，是一類重要的放線菌資源。本項目針對傳統技術的陽性菌株分離檢出率低、菌株分類鑑定困難等問題，以我國酸性土壤樣品為材料，採用分散差速離心和其它有效的理化法樣品預處理技術，並設計獨特的高選擇性分離培養基和培養條件，以獲得更多種可培養的假諾卡氏菌科分離菌株。運用屬特異引物PCR技術從大量分離菌株中快速篩選出假諾卡氏菌屬、糖多孢菌屬、糖單孢菌屬和擬無枝酸菌屬成員。運用PCR-SSCP技術去除重複菌株。發展和完善假諾卡氏菌科rep-PCR(BOX)指紋圖譜分子鑑定系統，為大量分離菌株的快速準確鑑定和科學分類提供有效的技術系統。運用多相分類手段，對假諾卡氏菌科新分類單位進行系統分類學研究，確定其分類地位和科學命名，挖掘和建立假諾卡氏菌科菌種資源庫，揭示物種多樣性，為超常物質和基因的開發儲備材料，研究成果將對假諾卡氏菌科系統學、資源學及生態學的研究具有重要指導意義。
結題摘要
已按照項目的研究計畫完成了研究任務。假諾卡氏菌科許多成員能產生生物活性物質，是一類重要的微生物資源，本項目針對傳統技術的陽性菌株分離檢出率低、菌株分類鑑定困難等問題，以我國酸性土壤樣品為材料，採用分散差速離心和其它有效的物理化學法樣品預處理技術，並設計出了高選擇性分離培養基和培養條件，建立了有效的選擇性分離培養方法。從各地採集的酸性土壤中共分離出490株放線菌菌株，其中270株為假諾卡氏菌科成員，分屬於10餘個屬，揭示出豐富的物種多樣性。分子鑑定結果表明屬特異引物PCR技術、PCR-SSCP技術和rep-PCR(BOX)技術是3種快速而有效的DNA指紋圖譜技術，具有準確、快捷、重現性好，簡便易行等特點，尤其適用於分析大量的菌株或分離株，有助於提高工作效率，降低實驗成本。運用屬特異引物PCR技術從大量分離菌株中快速篩選出了假諾卡氏菌屬、糖多孢菌屬、糖單孢菌屬和擬無枝酸菌屬成員。運用PCR-SSCP技術去除了重複菌株，快速篩選出了後續實驗的目的菌株，並在無序列的情況下基本反映出菌株間的系統進化關係。發現rep-PCR(BOX)基因指紋分析與16S rRNA基因序列分析結果具有較好的一致性，在此研究基礎上發展和完善了假諾卡氏菌科rep-PCR(BOX)指紋圖譜分子鑑定系統，為大量分離菌株的快速準確鑑定和科學分類提供了有效的技術系統。採用表觀特徵和基因型信息相結合的多相分類方法，對發現的7個新分類單位進行了系統分類學研究，確定了其分類地位，分別命名為淡黃色擬諾卡氏菌、黃色弗萊德門菌、深橘色遊動放線菌、海岸分枝桿菌、黃色馬賽菌、蒼黃馬賽菌和粘短波單胞菌，7個微生物新種已被國際公認，按照國際細菌命名規則進行了新種描述和生效發表。通過已建立的篩選方法和模型，篩選出了具有抗菌和降解等生物活性的菌株，挖掘和建立了假諾卡氏菌科菌種資源庫，結果顯示我國酸性土壤中蘊藏著寶貴的假諾卡氏菌科資源，具有潛在的套用前景，這對於尋找和發掘新的天然產物和功能菌株有重要的意義。本項目研究成果將對假諾卡氏菌科系統學、資源學及生態學的研究具有重要指導意義。已發表研究論文11篇，其中SCI論文(影響因子IF 2.268)共有7篇，核心期刊論文4篇。培養研究生6名。
