三界系統

顯微鏡廣泛使用後，發現了許多單細胞生物兼有動物和植物的特性（如眼蟲等），這中間類型的生物是進化的證據，卻是分類的難題。1859年達爾文的《物種起源》出版後，霍格（J.Hogg,1860）和赫克爾（E.Haeckel，1866）將所有單細胞生物和一些簡單的多細胞動植物，包括細菌、藻類、真菌和原生動物，歸在原生生物界，提出了一個力求反映生物親緣關係的三界分類系統，即除植物界和動物界外，增加一個原生生物界。