《pathway預測方法研究》是依託吉林大學,由周春光擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:pathway預測方法研究
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:周春光
- 依託單位:吉林大學
- 批准號:60873146
- 申請代碼:F0213
- 負責人職稱:教授
- 研究期限:2009-01-01 至 2011-12-31
- 支持經費:38(萬元)
項目摘要
生物信息學中的pathway預測研究對於理解生命系統中的生物過程以及疾病早期診斷方面具有十分重要的意義。本項目通過pathway元素識別和pathway結構圖的構建兩個階段來研究pathway預測方法,並將圖方法、聚類分析和統計學習理論等機器學習方法引入到pathway預測研究中,通過提出新的模型和算法來實現pathway的自動識別。在pathway預測中融合operon和regulon信息,進一步修正預測結果,從而提高預測的準確率;使用緊聚類方法預測pathway,能夠達到很好的容噪效果和在海量的基因表達數據里準確找到pathway對應的基因簇;使用pathway比對來挖掘模板pathway的共有結構模式,進而有效地進行pathway模板匹配。通過以上創新方法的研究,將促進系統生物學的套用基礎研究,從而加快pathway預測的實用化和商業化的研究進展。