miRNA和siRNA在生物調控網路中若干關鍵特徵分析和識別

《miRNA和siRNA在生物調控網路中若干關鍵特徵分析和識別》是依託吉林大學，由許志聞擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

• 中文名：miRNA和siRNA在生物調控網路中若干關鍵特徵分析和識別
• 項目類別：面上項目
• 項目負責人：許志聞
• 依託單位：吉林大學

項目摘要

從已有的基因序列特徵出發，根據全面的癌症實驗數據，分析和提取實驗的統計信息和序列特徵信息，力求發現具有相關的生物序列特徵和調控網路特徵，從miRNA和siRNA角度認識、發現和識別生物調控規律。具體完成以下幾項工作：1、通過建立基因、蛋白質、DOMAIN、miRNA和siRNA相互關聯的資料庫，以癌基因為基礎，根據各種癌症的實驗數據，分析和識別實驗數據和生物網路相關特性。2、採用已被證實RNA病毒致癌的特性，研究致癌的病毒、siRNA、致癌基因的相互關係，總結和發現癌基因、siRNA和病毒生物調控網路特徵。3、研究siRNA和miRNA的相互關係，從實驗數據和序列特徵比較兩者的作用，認識和發現兩者的序列特徵、生物調控網路特徵，判斷siRNA是否與miRNA的某些調控功能相同。4、採用人工智慧、模糊計算、聚類、貝葉斯分類、自動推理等技術發現miRNA和siRNA的生物調控規律。

結題摘要

癌症仍是人類難以攻克的惡疾，醫學研究者發現癌症的預測、發生和治療都與基因、miRNA有密切關係，病毒也會影響癌症的發生，同時研究表明siRNA與miRNA在序列和功能上有相似之處，通過siRNA來預測miRNA的功能將是治療癌症的一種可行的策略。我們研究的主要內容包括：癌症相關的病毒同癌症機制的研究；siRNA與miRNA的共性和特性對比分析，發現一些miRNA和某些siRNA具有相同結合位點序列，它們可能具有相近的功能，從而通過siRNA來分析miRNA在癌症中潛在的功能；分析siRNA，miRNA與病毒在癌症中的作用。基於癌症的實驗數據，主要是癌症相關（差異表達和非差異表達）的基因、miRNA及其調控關係構建和分析了基因與miRNA組成的癌症網路，構造了癌症的3種網路：差異表達網路，相關表達網路，總表達網路。提取了3種網路中關鍵調控關係並對比分析了它們的特點，提取了各種癌症中轉錄因子與miRNA間相互調控的重要關係。開發 miRNA與病毒的分析程式、siRNA與病毒的分析程式、同族病毒的比對程式以及病毒的小RNA致癌特徵分析軟體。構建基於實驗數據（癌症相關的基因與miRNA）的各種癌症調控網路，並構建相關的生物網路資料庫。我們的研究部分地揭示了癌症的發病機理，部分地揭示了病毒，miRNA，siRNA，基因在癌症中的作用，它們對癌症產生作用的機制。