肇東苜蓿抗寒過程中關鍵miRNA基因的篩選及其功能分析

肇東苜蓿抗寒過程中關鍵miRNA基因的篩選及其功能分析

《肇東苜蓿抗寒過程中關鍵miRNA基因的篩選及其功能分析》是依託哈爾濱師範大學,由束永俊擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

  • 中文名:肇東苜蓿抗寒過程中關鍵miRNA基因的篩選及其功能分析
  • 項目類別:青年科學基金項目
  • 項目負責人:束永俊
  • 依託單位:哈爾濱師範大學
項目摘要,結題摘要,

項目摘要

紫花苜蓿是多年生優質牧草,在我國,苜蓿生長主要集中在北方地區,這些地區氣候寒冷,容易發生低溫凍害,造成苜蓿減產,大大降低苜蓿的生產效益。因此,如何發掘紫花苜蓿的抗寒基因資源,培育抗寒苜蓿新品種,已成為我國苜蓿產業高產優質目標亟待解決的問題。本課題將以紫花苜蓿中優異的抗寒品種:肇東苜蓿為材料,通過小RNA測序,發掘肇東苜蓿抗寒過程中的關鍵microRNA基因,並鑑定它們在肇東苜蓿抗寒過程中的表達模式。同時,根據降解組測序結果,發掘microRNA基因調控的功能靶基因,並採用RACE方法進行靶基因切割驗證,確定microRNA-mRNA間的調控關係。整合發掘miRNA-mRNA調控關係和擬南芥的基因調控網路數據,構建肇東苜蓿抗寒過程中關鍵miRNA基因介導的基因調控網路,解析miRNA基因在肇東苜蓿抗寒過程中的分子調控機制,為紫花苜蓿的抗寒品種培育提供基因資源和科學依據。

結題摘要

紫花苜蓿是多年生優質牧草,富含蛋白質等營養成分,具有“牧草之王”的美譽。在我國,紫花苜蓿生長主要集中在北方地區,這些地區氣候寒冷,容易發生低溫凍害,造成苜蓿減產,大大降低苜蓿的生產效益。因此,如何發掘紫花苜蓿的抗寒基因資源,培育抗寒苜蓿新品種,已成為我國苜蓿產業高產優質目標亟待解決的問題。肇東苜蓿廣泛種植於我國東北地區,適應當地嚴寒氣候,是紫花苜蓿中優異的抗寒品種。因此,本項目以肇東苜蓿為研究材料,進行寒冷轉錄組測序、miRNA測序以及降解組測序,發掘紫花苜蓿中寒冷脅迫相關的miRNA基因、功能基因以及它們的調控模式。同時,整合模式植物的基因調控網路信息,構建紫花苜蓿基因調控網路,解析紫花苜蓿抗寒分子調控機制。主要研究結果如下: 1. 通過轉錄組測序,獲得了紫花苜蓿75551條UniGene序列,發掘寒冷脅迫回響基因5767個,主要集中在脅迫回響、激素調節和抗氧化調控等過程。進一步分析發現,AP2/ERF、WRKY、MYB等轉錄因子家族基因在紫花苜蓿寒冷脅迫過程中起重要調控作用。其中,10個AP2/ERF轉錄因子的表達模式得到了qRT-PCR的驗證,證實轉錄組測序平台結果可靠。 2. 通過小RNA測序,鑑定了197個紫花苜蓿miRNA基因在寒冷脅迫下的表達模式,其中,新的miRNA基因24個。發掘寒冷脅迫回響miRNA基因35個,其中12個miRNA基因表達模式得到qRT-PCR驗證。通過降解組測序,鑑定了105個miRNA調控的靶基因,建立了miRNA與mRNA間的調控模式。 3. 通過系統生物學方法,挖掘模式植物基因調控網路數據,構建紫花苜蓿基因調控網路,整合本研究發掘的miRNA與mRNA間調控模式,建立紫花苜蓿寒冷脅迫基因調控網路,系統地解析紫花苜蓿抗寒分子調控機制,為紫花苜蓿的抗寒品種培育提供基因資源和科學依據。

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