mRNA測序

mRNA測序，即messenger RNA 信使RNA是由DNA經由轉錄而來，帶著相應的遺傳訊息，為下一步轉譯成蛋白質提供所需的訊息。

概念

mRNA：即messenger RNA 信使RNA是由DNA經由轉錄而來，帶著相應的遺傳訊息，為下一步轉譯成蛋白質提供所需的訊息。在細胞中，mRNA從合成到被降解，經過了數個步驟。在轉錄的過程中，第二型RNA聚合酶從DNA中複製出一段遺傳訊息到mRNA前體pre-mRNA上。在原核生物中，除了5'加帽之外mRNA並未被進一步處理而經常是邊轉錄邊轉譯。在真核生物中，轉錄跟轉譯發生在細胞的不同位置，轉錄發生在儲存DNA的細胞核中，而轉譯是發生在細胞質中。

轉錄組學（transcriptomics）是在基因組學後新興的一門學科，即研究特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA（包括mRNA和非編碼RNA）的類型與拷貝數。Illumina提供的mRNA測序技術可在整個mRNA領域進行各種相關研究和新的發現。mRNA測序不對引物或探針進行設計，可自由提供關於轉錄的客觀和權威信息。研究人員僅需要一次試驗即可快速生成完整的poly-A尾的RNA完整序列信息，並分析基因表達、cSNP、全新的轉錄、全新異構體、剪接位點、等位基因特異性表達和罕見轉錄等最全面的轉錄組信息。簡單的樣品製備和數據分析軟體支持在所有物種中的mRNA測序研究。

測序流程

1）樣本準備（3days）

圖1所示。

2）上機測序1X40（single run，50h），2X80(PE，180h)，2X100(PE，220h)，2X120(PE，260h)，2X150(PE，320h)

3）圖像識別，Basecalling，過濾接頭序列，檢測可能的樣品污染。