cRNA探針

cRNA探針是以cDNA為模板，通過體外轉錄而獲得的。因為它是一種單鏈探針，因此也避免了套用雙鏈cDNA探針做雜交反應時存在的兩條之間的復性問題。cRNA與RNA之間形成的雜交體要比cDNA-RNA雜交體穩定。cRNA-RNA之間形成的雜交體不受RNA酶的影響。因此雜交反應後可用RNA酶處理，以除去未結合的探針。

由於cRNA探針具有以上這些優點，cRNA探針的雜交飽和水平又比雙鏈DNA探針高出8倍，因此在原位雜交中套用廣泛。cRNA探針的缺點是:探針的製備過程比較複雜，需要較好的分子生物學實驗設備，它對RNA酶敏感，易受破壞，操作中要謹防RNA酶污染。