基本特性
大腸桿菌的DNA連線酶是一條分子量為75KD的多肽鏈。對胰蛋白酶敏感,可被其水解。水解後形成的小片段仍具有部份活性,可以催化酶與NAD(而不是ATP)反應形成酶-AMP中間物,但不能繼續將AMP轉移到DNA上促進磷酸二酯鍵的形成。
DNA連線酶在大腸桿菌細胞中約有300個分子,和DNA聚合酶Ⅰ的分子數相近,這也是比較合理的現象。因為DNA連線酶的主要功能就是在DNA聚合酶Ⅰ催化聚合,填滿雙鏈DNA上的單鏈間隙後封閉DNA雙鏈上的切口。這在DNA複製、修復和重組中起著重要的作用,連線酶有缺陷的突變株不能進行DNA複製、修復和重組。噬菌體T4DNA連線酶分子也是一條多肽鏈,分子量為60KD,其活性很容易被0.2mol/L的KCl和精胺所抑制。
此酶的催化過程需要ATP輔助。T4DNA連線酶可連線DNA-DNA,DNA-RNA,RNA-RNA和雙鏈DNA粘性末端或平頭末端。另外,NH4C1可以提高在大腸桿菌DNA連線酶的的催化速率,而對T4DNA連線酶則無效。無論是T4DNA連線酶,還是大腸桿菌DNA連線酶都不能催化兩條游離的DNA鏈相連線。
主要種類
常用的DNA連線酶有兩種:來自大腸桿菌的DNA連線酶和來自噬菌體的T4DNA連線酶。二者的作用機理類似。T4連線酶作用分三步:
(1) T4DNA連線酶與輔助
因子ATP形成酶-AMP複合物。
(2) 酶-AMP複合物結合到具有5’-磷酸基和3’-羥基切口的DNA上,使DNA腺苷化。
作用機制
T4DNA連線酶作用機制:分子生物學試驗中主要採用T4DNA連線酶,因該酶在正常條件下,即能完成
連線反應。T4 DNA 連線酶是一單鏈多肽,分子量為68,000道爾頓,它能催化雙鏈DNA上相鄰的3ˊ羥基和5ˊ磷酸末斷形成
磷酸二脂鍵。λDNA用EcoRI酶切割後形成的6個片斷均具有
粘性末端(Cohesive ends),在T4 DNA 連線酶作用下,可連線成原來的線狀DNA。
T4DNA連線酶連線要求和結果
外源DNA末端性質
| 連線要求
| 連線結果
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不對稱粘性末端
| 兩種限制酶消化後,需純化載體以提高連線效率
| 載體與外源DNA連線處的限制酶切位點常可保留;非重組克隆的背景較低;外源DNA可以定向插入到載體中。
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對稱性粘性末端
| 線形載體DNA常需磷酸酶脫磷處理
| 載體與外源DNA連線處的限制酶切位點常可保留;重組質粒會帶有外源DNA的串聯拷貝;外源DNA會以兩個方向插入到載體中。
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平端
| 要求高濃度的DNA和連線酶
| 載體與外源DNA連線處的限制酶切位點消失;重組質粒會帶有外源DNA的串聯拷貝;非重組克隆的背景較高 。
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