Nonbinary SNP 遺傳標記在法醫親子鑑定中的套用研究

《Nonbinary SNP 遺傳標記在法醫親子鑑定中的套用研究》是依託中南大學，由扎拉嘎白乙拉擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

• 中文名：Nonbinary SNP 遺傳標記在法醫親子鑑定中的套用研究
• 項目類別：青年科學基金項目
• 項目負責人：扎拉嘎白乙拉
• 依託單位：中南大學

項目摘要

短串聯重複序列在遺傳過程中具有較高的突變率，在用於法醫親子鑑定時經常出現不符合遺傳學規律的現象，導致無法判斷親子關係甚至錯誤判斷親子關係。非二等位基因單核苷酸多態性（Nonbinary SNP）在以往的研究以及本課題前期工作中提示是一種具有低突變率的潛在法醫學遺傳標記。本研究將利用生物信息學方法從資料庫中選擇SNP，利用混池樣本Haloplex靶向基因捕獲晶片技術，尋找全基因組中的Nonbinary SNP；通過焦磷酸測序技術，驗證晶片結果、篩選可用於法醫親子鑑定的Nonbinary SNP並建立資料庫；基於篩選結果，利用SNaPshot法建立螢光複合體系，並檢測家系樣本，研究Nonbinary SNP在法醫親子鑑定中的套用價值和突變率。本研究將為法醫親子關係鑑定提供一種新的技術手段，同時可以建立Nonbinary SNP基因頻率資料庫，為其在法醫及其它學科中的套用提供數據支持。

結題摘要

短串聯重複序列是目前最常用的法醫用遺傳標記。但STR在遺傳過程中具有較高的突變率，在用於法醫親子鑑定時經常出現不符合遺傳學規律的現象，導致無法判斷親子關係甚至錯誤判斷親子關係。非二等位基因單核苷酸多態性在以往的研究以及本課題前期工作中提示是一種具有低突變率的潛在法醫學遺傳標記。本研究利用新一代測序技術從中國漢族人群混池樣本中篩選到了3400餘個Nonbinary SNP基因座。運用鹽析法，從100名長沙地區漢族無關個體基因組提取DNA，建立DNA樣本池。利用PSQ測序技術，調查在長沙漢族人群中SNP的等位基因數量，從候選47個SNP中篩選出40個基因座。通過對15名個體DNA樣本的單獨測序檢測，我們在40個多位基因SNP基因座觀察到了所有120個等位基因。基於上述15個DNA樣本，建立了2個多等位基因SNP的複合擴增體系（各包含20個基因座），擴增結果穩定，重複性好。以複合擴增產物為模板進行了多重單鹼基延伸反應，用毛細管電泳檢測結果顯示分型準確，結果可靠。40個三等位基因SNP螢光複合檢測系統對長沙地區100個無關漢族個體檢測結果顯示系統累計非父排除率大於0.9999，累計個人識別率達到了0.999999999999。對於法醫可行性樣本的檢測結果顯示：該系統對降解檢材的檢出率優於STR系統；當DNA模板量只有0.5ng時，系統的分型結果仍然穩定完整；該系統種屬特異良好，對6種不同生物樣本的分析中均無螢光檢測信號。最終，本研究從中國漢族人群中篩選到了40個非二等位基因SNP，通過這些基因座建立了一種基於非二等位基因SNP遺傳標記的法醫學複合檢測試系統，相較於二等位基因SNP只用少量的基因座就達到了較高的系統效能，同時也彌補了STR因突變而影響親子鑑定結果的缺點以及分析降解樣本的不足。該非二等位基因SNP可一次性快速、準確地獲得生物檢材的40個多等位基因SNP遺傳標記的分型，為法醫個人識別和親子鑑定提供了一種新的技術手段。