馬斯特里赫特大學下屬的經濟學院（SBE）是荷蘭乃至歐洲最好的學院之一，取得了EQUIS、AACSB、AMBA三項世界頂級認證，是世界上極少數同時擁有這三項皇冠認證的大學之一。其在人工智慧方面的研究同樣位於歐洲前列，同時該校的醫學、藝術音樂和語言學同樣聲名遠揚。另外，土豆網的技術開發也出自馬大的技術人員之手。2004-2005，馬斯特里赫特大學連續被荷蘭教育部評為教學質量最好的大學。06年以來，在荷蘭高等教育委員會評估一直獲得最高分數，位列高校前三甲，是荷蘭頂尖大學之一。世界排名方面，英國泰晤士報世界高校排行（UK Times Higher Education）里，馬斯特里赫特大學排名世界前120（2009年），雄居歐洲50強大學之列；同時為人文社科類高校世界前五十強，國際學生評價占歐洲第5。在美國US news and World reprot的世界大學排名中，馬斯特里赫特大學排在第110位（2008年）。而在俄羅斯最新發布的Rating of Educational Resources 2010 中，馬斯特里赫特大學排名第100位。
