Ka/Ks

Ka/Ks,在遺傳學中,Ka/Ks或者dN/dS表示的是異義替換(Ka)和同義替換(Ks)之間的比例。這個比例可以判斷是否有選擇壓力作用於這個蛋白質編碼基因。

基本介紹

不導致胺基酸改變的核苷酸變異我們稱為同義突變,反之則稱為非同義突變。一般認為,同義突變不受自然選擇,而非同義突變則受到自然選擇作用。在進化分析中,了解同義突變和非同義突變發生的速率是很有意義的。常用的參數有以下幾種:同義突變頻率(Ks)、非同義突變頻率(Ka)、非同義突變率與同義突變率的比值(Ka/Ks)。如果Ka/Ks>1,則認為有正選擇效應。如果Ka/Ks=1,則認為存在中性選擇。如果Ka/Ks<1,則認為有純化選擇作用。

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