1. In silico的基本定義：
In silico是指“在矽之中”，也就是“進行於電腦中，或是經由電腦模擬”之意，此用語是衍生自另外兩個在生物學上常用的詞組：in vivo（生物活體內）及in vitro（生物活體外）。但與這兩個詞組不同的是，in silico在拉丁文中並不存在。
2. In silico的詞源：
1989年，in silico首次出現在美國新墨西哥"Cellular Automata: Theory and Applications 細胞自動機：理論與套用"的實驗室。一位名為Pedro Miramontes的數學家發表文章 "DNA and RNA Physicochemical Constraints, Cellular Automata and Molecular Evolution". 文章中，Miramontes首次使用了詞組"In silico"來定義“完全在電腦中模擬進行的生物實驗”。這項工作後來成為Miramontes的博士畢業論文的內容。如今"In silico" 這個詞組的使用者幾乎遍布全球，甚至出現在了一個學術雜誌的名稱里 (In Silico Biology，即模擬生物學）
"in silico" 一般只用來定義自然科學中的生物模擬實驗的過程，與其他一般的計算機模擬無關。
3. 擴展閱讀：
“顯然，我們很難為in silico下一個完整的定義，就像我們無法對in vivo（in the living system）及in vitro（in the test tube）給予一個完美的中文含義一樣。in silico代表著一個有別於傳統生物學的新的學科，或許是計算機生物學（computational biology）抑或生物信息學（bioinformatics）？它的意義是多層面的，廣泛的，沒有固定界限的。儘管這個新的概念尚未被廣大的實驗生物學者所認同，但您將不得不要面對大量的in silico文獻。也許您已經遭遇了in silico Biology或in silico Mapping，千萬不要將其理解成“電子生物學”或“電子定位”。我們寧願稱其為“in silico生物學”或“in silico定位”。這就是in silico，生命科學的新概念，我們無法拒絕。”
