IPA(通路分析軟體)

IPA(Ingenuity Pathway Analysis)，是基於雲計算的一體化生物通路分析軟體。其在高度結構化的生物信息平台Ingenuity Knowledge Base支持下，一方面可以搜尋基因、蛋白、藥物等的各類相關信息，並構建相互作用模型；另一方面還可以分析來源於基因組、micro-RNA、SNP、晶片、代謝組、蛋白組等的實驗數據。

近年來，隨著IPA軟體的發展和完善，已經廣泛地被生命科學研究學界接受，並且目前使用IPA處理數據發表的論文高達上萬篇，如在疾病發病機理、癌症等方面。

基本介紹

• 中文名：IPA
• 外文名：Ingenuity Pathway Anaylsis
• 特點：易用，及時，全面等
• 類型：通路分析軟體
• 平台：Ingenuity Knowledge Base
• 語言：英語
• 作業系統：Windows, Linux, Mac

基本信息

軟體名字：IPA

作者：cloudscientific.com

更新時間：2014-10-01

版本：1.0

系統：Android 2.2.x以上

語言：其他

套用介紹

安全無毒

TheInternationalPediatricAssociation(IPA)wasformedinParisin1910byagroupofEuropeanped

套用領域

基因組學、轉錄組學

IPA可以用於套用於絕大多數基因、轉錄組的生物學問題。

·探索性實驗：尋找有意義的分子、功能或者作用機制

·轉錄調控：尋找可能的轉錄因子、轉錄調控網路

·疾病分類：多基因分型，找到區分不同亞型的關鍵分子

·毒理基因組學：結合轉錄組學和毒理學，找到毒物作用的靶標

蛋白質組學

IPA可以對試驗得到的蛋白質組數據進行相對較全面的分析，深入了解蛋白質表達機制和相關生物學過程。如翻譯後修飾；信號通路傳遞機制；蛋白相互作用；差異蛋白標誌物篩選等。

microRNA研究

IPA軟體中microRNA研究包括功能研究與調控篩選兩部分。

·microRNA功能研究：找到現有的miRNA作用於疾病的方式

·microRNA-mRNA調控篩選：結合miRNA和mRNA數據，找到兩者作用關係

代謝組學

IPA可以為代謝物研究提供關鍵的調控信息，進而更好的理解代謝組數據中從細胞形態學到代謝作用機制的信息。如:代謝過程通路分析；尋找並可視化代謝物調控或合成過程等。

藥物研究

通過藥物對不同疾病組織的刺激結果的表譜分析，從而發現已知藥物的新套用領域，包括網路藥理學藥物重定位、中草藥活性成分調控機制等。

生物標誌物發現

IPA可以從試驗數據集中識別最相關，最有潛力的候選生物標誌物，具體如下：

·生物標誌物進展篩選：篩選目標分子在各類疾病中的臨川篩查的套用進展和套用類型

·生物標誌物套用可行性預測：快速篩選相關分子在各器官、各組織中的表達情況和臨床可檢測情況

軟體特點

準確性高

IPA軟體中涵蓋的數據、文獻等均為生命科學領域的專家們從各大專業的雜誌與期刊中人工摘取的。

及時性好

IPA軟體中的資料庫由500多名博士每周閱讀文章並進行更新，這保證了其及時性。

易用性好

IPA軟體是專為生物學家開發的，因此操作簡單，易於使用。

分析全面

IPA軟體數據分析基於IPKB整套分析工具。