CHIRP-Seq( Chromatin Isolation by RNA Purification )是一種檢測與RNA綁定的DNA和蛋白的高通量測序方法。方法是通過設計生物素或鏈霉親和素探針,把目標RNA拉下來以後,與其共同作用的DNA染色體片段就會附在到磁珠上,最後把染色體片段做高通量測序,這樣會得到該RNA能夠結合到在基因組的哪些區域,但由於蛋白測序技術不夠成熟,無法知道與該RNA結合的蛋白。