BLAST全稱Basic Local Alignment Search Tool，即“基於局部比對算法的搜尋工具”，是生物信息學常用的工具軟體，可將輸入的核酸或蛋白質序列與資料庫中的已知序列進行比對，獲得序列相似度等信息，從而判斷序列的來源或進化關係。
基本介紹
- 軟體名稱：BLAST
- 開發商：NCBI
- 軟體平台：多種
- 軟體語言：英語
BLAST全稱Basic Local Alignment Search Tool，即基於局部序列比對算法的搜尋工具。是由美國國家生物技術信息中心(National Center for Biotechnology Information，NCBI)開發和管理的一套生物大分子一級結構序列比對程式。"BLAST"是美國國立醫學圖書館（U.S. National Library of Medicine）的註冊商標。
程式可將輸入的核酸鹼基或蛋白質胺基酸序列與資料庫中的已知來源序列進行比對，輸出序列之間的同源性信息，從而輔助判斷輸入的序列來源或與已知序列的進化關係。目前這套軟體包含五種基本功能：
核酸序列對核酸序列庫比對（blastn）：直接將輸入的核酸序列與資料庫中的核酸序列進行比對。
核酸序列對蛋白質序列庫比對（blastx）：自動將輸入的核酸序列翻譯為蛋白質胺基酸序列後（根據可能的讀碼框和編碼鏈的差別，一段核酸序列可能翻譯為六種胺基酸序列），比對資料庫中的蛋白質序列。
蛋白質序列對蛋白質序列庫比對（blastp）：直接將輸入的蛋白質胺基酸序列與資料庫中的胺基酸序列進行比對。
蛋白序列對核酸序列庫比對（tblastn）：將輸入的蛋白質胺基酸序列，與由核酸資料庫中的序列翻譯而來的潛在的蛋白質胺基酸序列進行比對。
核酸序列的翻譯序列對核酸序列庫的翻譯序列的比對（tblastx）：自動將輸入的核酸序列翻譯為蛋白質胺基酸序列後，與由核酸資料庫中的序列翻譯而來的潛在的蛋白質胺基酸序列進行比對。
BLAST程式有線上版亦有本地版。線上版可將輸入序列與龐大的已知來源序列信息庫進行比對，一般用於確定未知序列的來源，以及尋找不同物種中的同源基因；本地版是將輸入序列與本地自行構建的序列信息庫進行比對，比對的針對性更強，常用於在未發表基因組資料庫中尋找同源基因信息，不依賴於網路，安全性和可靠性更高。
