3′端是2008年公布的生物化學與分子生物學名詞。
中文名稱 | 3′端 |
英文名稱 | 3′-end |
定 義 | DNA或RNA單鏈帶有游離3′-羥基或其磷酸酯的一個末端。一條核酸鏈通常從5′端到3′端書寫。 |
套用學科 | 生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科) |
基本介紹
- 中文名:3′端
- 外文名:3′-end
- 所屬學科:生物化學與分子生物學
- 公布年度:2008年
3′端是2008年公布的生物化學與分子生物學名詞。
中文名稱 | 3′端 |
英文名稱 | 3′-end |
定 義 | DNA或RNA單鏈帶有游離3′-羥基或其磷酸酯的一個末端。一條核酸鏈通常從5′端到3′端書寫。 |
套用學科 | 生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科) |
3′端是2008年公布的生物化學與分子生物學名詞。1定義DNA或RNA單鏈帶有游離3′-羥基或其磷酸酯的一個末端。一條核酸鏈通常從5′端到3′端書寫。出處《生物化學與分子生物學名詞》。...
3′非翻譯區 3′非翻譯區(3′untranslated region)是2020年公布的畜牧學名詞。定義 mRNA分子3′端不編碼蛋白質的序列或對應的DNA序列。出處 《畜牧學名詞》。
5′端 5′端(5′-end)是2008年公布的生物化學與分子生物學 名詞。定義 DNA或RNA單鏈帶有游離5′-羥基或其磷酸酯的一個末端。一條核酸鏈通常從5′端到3′端書寫。出處 《生物化學與分子生物學名詞》。
在核酸化學中,引物是一段短的單鏈RNA或DNA片段,可結合在核酸鏈上與之互補的區域,其功能是作為核苷酸聚合作用的起始點,核酸聚合酶可由其3′端開始合成新的核酸鏈。體外人工設計的引物被廣泛用於聚合酶鏈反應、測序和探針合成等。我們已經知道3‘——5’這條鏈為負鏈,其引物為正向引物(又稱為有義鏈引物(...
基因盒通常不含啟動子,但一旦基因盒插入整合子,這個基因就能在5′端的共同啟動子Pant作用下轉錄。基因盒是由一個ORF(通常是耐藥基因)和一個反向不完全重複序列即59-be組成,59-be片段交換位點長度從50 bp ~150 bp不等。在反向重複序列的5′端有一個長7 bp反向核心位點RYYYAAC;在3′端有一個核心位點GTT...
冠狀病毒在系統分類上屬套式病毒目(Nidovirales)冠狀病毒科(Coronaviridae)冠狀病毒屬(Coronavirus)。冠狀病毒屬的病毒是具囊膜(envelope)、基因組為線性單股正鏈的RNA病毒,是自然界廣泛存在的一大類病毒。冠狀病毒直徑約80~120nm,基因組5′端具有甲基化的帽狀結構,3′端具有poly(A)尾,基因組全長約27-...
tRNA是通過分子中3′端的CCA攜帶胺基酸的。胺基酸連線在腺苷酸的2′或3′OH基上,攜帶了胺基酸的tRNA叫氨醯tRNA,例如,攜帶甘氨酸的tRNA叫甘氨醯tRNA。胺基酸與tRNA的結合由氨醯tRNA合成酶催化,分二步進行:①胺基酸+ATP→氨醯-AMP+焦磷酸;②氨醯-AMP+tRNA→氨醯-tRNA+AMP。與一種胺基酸對應的至少有一種...
末端內含子 生物化學與分子生物學名詞。定義 RNA前體供體的3′端和受體的5′端序列。在反式剪接時被剪接除去,不出現在成熟信使核糖核酸(mRNA)中。出處 《生物化學與分子生物學名詞》。
內含子分支點 內含子分支點,位於內含子3′端剪接點上游18至40核苷酸之間。酵母細胞中該序列高度保守,共有序列為UACUAAC;高等真核細胞的內含子分支點序列的保守程度較低,為PyNPyPyPuAPy(Py為嘧啶核苷酸、Pu為嘌呤核苷酸、N為任意核苷酸)。剪接時通過轉酯反應形成套索RNA。
已從動物、植物、病毒及微生物中分離到許多適用於植物的啟動子。根據作用方式及功能可將啟動子分為3 類:組成型啟動子、誘導型啟動子和組織特異型啟動子。 植物基因工程中常採用的終止子是胭脂鹼合成酶的nos終止子和Rubisco小亞基基因的3′端區域。分類 ①組成型啟動子(constitutive promoter)是指在該類啟動子控制...
黏端是2008年公布的生物化學與分子生物學名詞。定義 雙鏈DNA片段末端的一種形式。其中兩條鏈的3′或5′具有突出的單鏈末端,這種末端可以與同一DNA片段上另一末端的互補的突出序列相連而形成一個環狀分子,或與另一DNA片段形成更大的DNA分子。多數Ⅱ型限制性核酸內切酶對DNA的切割能產生黏端。出處 《生物化學與...
分支點序列 (branch-point sequence ),位於核mRNA內含子和 = 2 \* ROMAN II 類內含子3′端附近的保守序列:YNCURAY(Y: 嘧啶,R:嘌呤, N:任何鹼基),其中的A可通過5′-2′連線的方式和內含子5′ 端相連線,在剪接時形成套索狀結構。
接合轉移(Conjugative transfer)是細菌之間通過直接或間接接觸,交換質粒的過程。通常細菌間環型質粒在接合轉移過程中,單鏈質粒DNA在質粒內部“oriT”接合轉移起始位點發生缺刻.隨後,打開的單鏈質粒DNA通過細胞膜N1V型分泌系統轉移到受體菌中.但是,鏈黴菌中的接合型線型質粒帶有游離3′端,5′端與末端蛋白結合,...
黏[性末]端(cohesive end,cohesive terminus,sticky end)是2019年公布的植物學名詞。定義 雙鏈DNA片段末端的一種形式。其中兩條鏈的3′或5′具有突出的單鏈末端,這種末端可以與同一DNA片段上另一末端互補的突出序列相連而形成一個環狀分子,或與另一DNA片段形成更大的DNA分子。多數Ⅱ型限制性核酸內切酶對DNA的...
tRNA前體在tRNA剪下酶作用下,切成一定大小的分子。大腸桿菌RnaseP特異切割tRNA前體5′旁側序列,3′-核酸內切酶如RnaseF可將tRNA前體3′端一段序列切下來。RnaseD可水解3′端多餘核甘酸。剪下後的tRNA分子在拼接酶作用下,將成熟tRNA分子所需片斷拼接起來。(2)稀有鹼基的生成 (1)甲基化:例如在tRNA甲基轉移酶...
一旦當這一類似物被結合,其3′-端因缺少羥基而不再是鏈伸長所需的底物,從而使伸長中的DNA鏈終止。在實際操作中,使用DNA聚合酶I的克倫諾片段(Klenow fragment),它缺乏完整酶的5′,3′-核酸外切酶的活性。DNA的合成是在有四個脫氧核苷三磷酸酯的存在下進行,其中有一個或幾個用32p作了標記,四個反應混合物...
3′端避開密碼子第3位 如擴增編碼區域,引物3′端不要終止於密碼子的第3位,因密碼子的第3位易發生簡併,會影響擴增的特異性與效率。選擇T 引物3′端錯配時,不同鹼基引發效率存在著很大的差異,當末位的鹼基為A時,即使在錯配的情況下,也能有引發鏈的合成,而當末位鏈為T時,錯配的引發效率大大降低,...
同源盒基因均含有180bp的高度保守序列,且在進化上高度保守,位於靠近3′端的分散的外顯子上。這段序列編碼60個胺基酸的同源結構域。HD摺疊成3個α-螺旋結構。X-射線晶體學研究表明,螺旋Ⅰ與Ⅱ平行,螺旋Ⅲ與前2個基本垂直,Ⅱ、Ⅲ螺旋和它們之間的轉折形成HTH(helix-turn-helix)結構。同源盒 是一段編碼60個...
TaqMan技術是利用Taq酶的5′外切酶活性,合成一個能與PCR產物雜交的探針。探針的5′端和3′端分別標記不同的螢光基團,其中3′端的螢光基團能夠吸收5′端螢光基團發出的螢光。這樣在正常情況下只能檢測到3′端螢光基團的螢光信號,而5′端螢光基團發出的螢光是檢測不到的。當溶液中含有目標PCR產物時,探針與產物...
平端化是2008年公布的生物化學與分子生物學名詞。定義 將雙鏈DNA兩端突出的單鏈區變成平端的過程。通常對雙鏈的5′突出端,可用克列諾(Klenow)酶或T4 DNA聚合酶延伸補平;如果是3′突出端,可用T4 DNA聚合酶切去3′突出部分而削平。也可以用單鏈特異的核酸酶切除突出單鏈。出處 《生物化學與分子生物學名詞》...
突變擴增系統(amplification refractory mutation system,ARMS)又稱等位基因特異性擴增法(allele specific amplification,ASA),是Newton等首先建立用來檢測已知突變的方法。其基本原理是,如果引物的3′端鹼基與模板鹼基不互補,則用一般耐熱DNA聚合酶無法延伸。因此根據已知點突變設計3條引物(見引物設計),其3′端鹼基分別...
轉移RNA前體 轉移RNA前體是大約比成熟的分子大20%的,在5′和3′兩端有額外的核苷酸序列的一種tRNA。對原核生物而言,這些額外序列是由專一的RNase P和RNase Q分別催化5′和3′端裂解而去除。
在脫氧核苷酸轉移酶(也稱末端轉移酶)的作用下可以在DNA的3′羧基端合成低聚多核苷酸。如果把所需要的DNA片段接上低聚腺嘌呤核苷酸,而把載體分子接上低聚胸腺嘧啶核苷酸,那么由於兩者之間能形成互補氫鍵,同樣可以通過DNA連線酶的作用而完成DNA片段和載體間的連線。這叫做同聚末端連線。①利用限制酶取得具有粘性末端或...
兩個引物之間不應存在互補序列,尤其是避免3 ′端的互補重疊。引物與非特異擴增區的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續8個鹼基在待擴增區以外不能有完全互補序列,否則易導致非特異性擴增。引物3‘端的鹼基,特別是最末及倒數第二個鹼基,應嚴格要求配對,最佳選擇是G和C。引物的5′端可以修飾。如附加...
mRNA濃度是翻譯起始速率的主要影響因素之一,密碼子直接影響轉錄效率,決定mRNA濃度。如單子葉植物在“翻譯起始區”的密碼子偏性大於“翻譯終止區”,暗示“翻譯起始區”的密碼子使用對提高蛋白質翻譯的效率和精確性更為重要,因此,通過修飾編碼區5′端的DNA序列,來提高蛋白質的表達水平將有望成為可能。影響蛋白質的...
方法:以pUC18/TK重組質粒DNA為模板,用PCR方法擴增TK5′端503bp基因片段,並將擴增的片段克隆入載體pUC18中(pUC18/TK1);用PstI和HindⅢ雙酶切pUC18/TK,獲得TK3′端383bp片段,將此酶切片段克隆入pUC18/TK1中,並進行測序。結果:構建成重組質粒pUC18/TK-。經酶切鑑定獲得1條約900bp的基因片段;序列測定證實...
真核生物RNA聚合酶有3類(不包括真核細胞線粒體中類似原核的RNA聚合酶),由8~12條亞基組成,分子量高達80萬。初步的研究指出,它們也可能存在類似原核的σ亞基組分。轉錄過程 在轉錄過程中,DNA模板被轉錄方向是從3′端向5′端;RNA鏈的合成方向是從5′端向3′端。RNA的合成一般分兩步,第一步合成原始轉錄...
複製使端粒5′末端縮短,而端粒酶(telomerase)可外加重複單位到5′末端上,結果維持端粒一定長度。端粒通常是由富含鳥嘌呤核苷酸(G)的短的串聯重複序列組成,伸展到染色體的3,端。一個基因組內的所有端粒,即一個細胞里不同染色體的端粒都由相同的重複序列組成,但不同物種的染色體端粒的重複序列是各異的。哺乳...
用去垢劑處理骨髓瘤後所獲得的多核糖體與膜分離,然後在離體的條件下繼續進行新生肽的合成。經短時溫育得到的是成熟的IgG,而長時溫育得到的是前體IgG,此表明mRNA5’端核糖體上合成的新生肽尚未來得及加工,而在3′端核糖體上合成的新生肽在核糖體未分離前已部分進入rER,經過了加工,切除了N-端的部分。在以上...
將禽流感病毒H9N2亞型毒株核蛋白(NP)基因3′端較為保守的、約350bp的編碼序列通過限制性內切酶Hae¸切割、分離後,用隨機引物法製備Digoxigenin2112dUTP標記探針。測定該探針的濃度為100Lgöml。特異性試驗發現該探針只能與實驗室構建的、含有NP基因的重組載體pGEM2TE2NP和pBacPAK2NP以及A型流感病毒H9N2亞型...