傳說公元800多年前，著名瑜伽師拉龍巴多刺殺吐蕃王朗達瑪後逃往玉樹隱居在龍秀時，在原有的一座
苯教寺院的基礎上建起了一座寧瑪教帳篷寺院。公元1390年，藏傳佛教直貢噶舉派創始人覺哇久丁桑貢將龍秀寺改宗為直貢噶舉派寺院。公元1468年，著名活佛康角昂喀寧寶和秋君昂加又將龍秀寺改宗為
格魯派寺院。到公元1862年，寺院擴建了經堂、佛殿、佛塔和僧舍等。形成了11個活佛轉世系統。較大的有牟薩嘉貢轉世系統、江格轉達世系統和尼智轉世系統等。玉樹解放初期該寺僧侶多達上千名，形成相當規模的一座寺院。
在第五世尼智活佛（現任
玉樹藏族自治州政協委員、
玉樹縣政協副主席）主持下，經過十幾年的不斷修建，該寺在經堂及佛用佛殿建築和佛像雕塑方面超過了以前的規模，使寺院顯得氣勢壯觀，金碧輝煌。近幾年還修建了菩提道及密宗、講修、因明（佛教哲學）等專修僧院，寺內文物眾多，壁畫及雕塑很有觀賞價值。
