黃晶(西湖大學生命科學學院教師)

黃晶(西湖大學生命科學學院教師)

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黃晶,1984年生,江西南昌人,博士研究生,現為西湖大學生命科學學院教師,百圖生科分子動力學模擬及理性藥物設計顧問。

基本介紹

  • 中文名:黃晶
  • 國籍中國
  • 出生日期:1984年
  • 畢業院校:清華大學,瑞士巴塞爾大學
  • 職業:大學教師,科研工作者
  • 學歷:博士研究生
個人簡介,人物經歷,代表性論文,

個人簡介

清華大學物理系本科(2005)碩士(2007),瑞士巴塞爾大學化學系博士(2011),美國馬里蘭大學藥學院(2012-2017)和國立衛生研究院計算生物學實驗室(2015-2017)博士後。
2017年11月加入西湖大學生命科學學院,組建和領導計算生物物理與藥物設計實驗室。

人物經歷

黃晶是生物體系分子動力學模擬及理性藥物設計的專家,尤其關注於計算模型的開發與算法的改進。2005和2007年在清華大學物理系獲學士與碩士學位,2011年於瑞士巴塞爾大學化學系獲博士學位。之後受瑞士自然科學基金“潛力研究者”資助赴美,在美國馬里蘭大學藥學院和NIH計算生物學實驗室做博士後研究。2017年回國加入西湖大學生命科學學院,組建和領導計算生物物理與藥物設計實驗室,並主持西湖實驗室人工智慧藥物設計核心實驗室。

代表性論文

1.J. Huang, J. Lemkul, P. Eastman, and A. MacKerell Jr.,Molecular Dynamics Simulations Using the Drude Polarizable Force Field on GPUs with OpenMM: Implementation, Validation, and Benchmarks,J. Comp.Chem., 39:1682,2018
2.J. Huangand A. MacKerell Jr.,Force Field Development and Simulations of Intrinsically Disordered Proteins,Curr. Opin. Struct. Biol., 48:40,2018
3.J. Huang,* A. Simmonett, F. Pickard, A. MacKerell Jr., and B. Brooks,Mapping the Drude Polarizable Force Field onto a Multipole and Induced Dipole Mode,J. Chem. Phys.,147:161702,2017
4.J. Huang, S. Rauscher, G. Nawrocki, T. Ran, M. Feig, B. de Groot, H. Grubmueller, and A. MacKerell Jr.,CHARMM36m: An Improved Force Field for Folded and Intrinsically Disordered Proteins,Nat. Methods, 14:71,2017
5.J. Huang, Y. Mei, G. Konig, A. Simmonett, F. Pickard, Q. Wu, L.-P. Wang, A. MacKerell Jr., B. Brooks, and Y. Shao,An Estimation of Hybrid Quantum Mechanical Molecular Mechanical Polarization Energies for Small Molecules Using Polarizable Force-Field Approaches,J. Chem. Theo. Comput., 13:679,2017

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