黃子萬早年在川軍中充當下級軍官。抗日戰爭爆發時，在川康綏署學員隊當隊長。經常帶領學員到郊區以壁報、話劇等形式，宣傳抗戰，動員民眾有錢出錢，有力出力，支援前線。
隨後，根據黨的指示，冒著生命危險，機智地打入了國民黨內部。他和王俠夫、曾鳴飛、谷時遜等身穿國民黨軍裝，卻肩負著為黨和人民利益而奮鬥的神聖使命。1938年，在武德勵進會服役，經該會中共地下組織吸收為中國共產黨黨員。從1938年至1944年間，曾受川康特委統戰部長劉正領導，擔任黨的交通員。還與其他同志一起，策動安排劉湘軍隊中有正義感的人員，去中蘇文化協會，聽民主人士的時事報告。特別是代表中共中央參加國民黨參政會的幾位參政員董必武、林伯渠、陳紹禹路過成都時，曾在中蘇文化協會作時事報告，他和其他黨員抓住機會組織了許多民眾去聽報告，以擴大黨的影響。1940年，國統區白色恐怖日益嚴重，他轉由中共四川省工委成員張曙時領導，做川軍上層人士的策反工作。1944年，在胡春浦（中共南方局領導，在成都做上層統戰和情報工作）領導下，從事革命活動。1942年，黨組織派他到軍運小組工作。從此，利用軍管區軍官的合法身份，秘密從事軍運活動。1949年1月13日，中共川康特委遭到特務破壞，特委主要負責人被捕，因而他和曾鳴飛、谷時遜也被敵人逮捕。敵人對他們肆意施用各種酷刑，但無論多么殘酷的刑罰，也摧毀不了真正共產黨員的鋼鐵意志。1949年12月7日深夜，國民黨特務將其殺害。
