魚亮，女，博士，西安電子科技大學計算機學院副教授、博士生導師。
基本介紹
- 中文名：魚亮
- 學位/學歷：博士
- 職業：教師
- 職務：西安電子科技大學計算機學院博士生導師
- 任職院校：西安電子科技大學計算機學院
個人經歷,主講課程,研究方向,學術成果,榮譽獎項,
個人經歷
於2017年9月至2018年9在哈佛醫學院訪問一年。
主講課程
主講本科《離散數學I》、《離散數學II》、《數據倉庫與數據挖掘》
主講研究生《數據挖掘原理與套用》
研究方向
1．數據挖掘
2 . 網路醫學
3．聚類
4．複雜疾病
5．計算生物信息學
學術成果
科學研究
1.國家重點研發計畫“精準醫學研究”專項 “多維生命組學數據智慧型整合分析”課題 課題三、多維生命組學數據智慧型整合分析 骨幹成員
2.國家自然基金面上項目
基於組織多層網路模型的藥物重定位方法研究承擔藥物-疾病相關性算法的研究 項目負責人
3.國家青年科學基金項目：
基於蛋白質相互作用網路的疾病模組挖掘承擔疾病基因預測算法的研究 項目負責人
4.陝西省自然科學基金項目
藥物靶標預測及藥物重新定位方法研究 承擔藥物重定位算法的研究 項目負責人
5.國家自然基金重點項目
基於網路模型的癌症相關模式挖掘理論與方法承擔模式算法的研究 主要參與人（項目負責人 高琳）
6.國家自然基金重大研究計畫項目：
複雜疾病惡化過程相關模式發現理論與方法研究 承擔疾病模式算法的研究 主要參與人（項目負責人 高琳）
7.國家自然基金重點項目：
生物網路數據分析與挖掘中相關理論與關鍵技術 承擔模組挖掘算法的研究 主要參與人（項目負責人 高琳）
基於圖挖掘的蛋白質網路功能模組識別算法 主要參與人
9.中央高校基本科研業務費專項資金資助：蛋白質網路功能模式挖掘及套用研究 項目負責人
11.國家自然科學基金資助項目：協同學習模式下流數據的聚類與預測聯合實現方法研究 主要參與人
學術論文
- 魚亮，趙晉.基於組織特異性和直接鄰居相似度方法預測疾病-藥物關係.中國科學:信息科學;
- Liang Yu, Shunyu Yao, Lin Gao, Yunhong Zha. Conserved disease modules extracted from multil[ant]ayer heterogeneous disease and gene networks for understanding disease mechanisms and predicting disease treatments.Frontiers in Genetics.
- Liang Yu, Lin Gao. Human pathway-based disease network.IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, Accepted.
- Liang Yu, Jin Zhao, Lin Gao. Predicting Potential Drugs for Breast Cancer based on miRNA and Tissue Specificity.International Journal of Biological Sciences,
- Liang Yu, Xiaoke Ma, Long Zhang, Jing Zhang, Lin Gao. Prediction of new drug indications based on clinical data and network modularity.Scientific Reports,
- Liang Yu, Ruidan Su, Bingbo Wang, Long Zhang, Yapeng Zou, Jing Zhang, Lin Gao. Prediction of novel drugs for hepatocellular carcinoma based on multi-source random walk.IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics,
- Liang Yu,Bingbo Wang, Xiake Ma, Lin Gao. The extraction of drug-disease correlations based on module distance in incomplete human interactome.BMC System Biology.
- Liang Yu, Jianbin Huang, Zhixin Ma, Yapeng Zou, Jing Zhang, Lin Gao. Inferring drug-disease associations based on known protein complexes.BMC medical genomics,
- Liang Yu, Jin Zhao, Lin Gao. Drug repositioning based on triangularly balanced structure for tissue-specific diseases in incomplete interactome.Artificial Intelligence In Medicine,
- Liang Yu, Lin Gao, and Chuiliang Kong. Identification of core-attachment complexes based on maximal frequent patterns in protein-protein interaction networks.Proteomics,
- Liang Yu, Lin Gao, and Penggang Sun. A hybrid clustering algorithm for identifying modules in Protein Protein Interaction networks.International Journal of Data Mining and Bioinformatics,
- Liang Yu, Lin Gao, Kui Li. A degree-distribution based hierarchical agglomerative clustering algorithm for protein complexes identification.Computational Biology and Chemistry,
- Liang Yu, Lin Gao, and Kui Li. A method based on local density and random walks for complex detection in protein interaction networks.Journal of Bioinformatics and Computational Biology,
- 魚亮,高琳，孫鵬崗.蛋白質網路中複合體和功能模組預測算法研究.計算機學報,
- Liang Yu, Lin Gao. Identification of core-attachment complexes based on mining maximal frequent patterns in protein-protein interaction networks. 2010 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine Workshops (BIBMW 2010), pp, 29-34. Dec. 18-21, 2010, Hong Kong.
- Liang Yu, Lin Gao. Quantitative Function for Community Structure Detection.International Journal of Data Mining, Modelling and Management,
- Liang Yu, Lin Gao. An average-degree based method for protein complexes identification. The Fourth International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (iCBBE2010) Proceedings, pp. 175-182, June 18-20, Chengdu, China.
- Xiaoke Ma,Liang Yu, Peizhuo Wang, Xiaofei Yang, Discovering DNA methylation patterns for long non-coding RNAs associated with cancer subtypes.Computational Biology and Chemistry.
- Xiaoke Ma, Bingbo Wang,Liang Yu. Semi-supervised spectral algorithms for community detection in complex networks based on equivalence of clustering methods. Physica A.
