貫徹執行國家和省、市有關水路運輸、港口碼頭（含搬運裝卸）管理的方針、政策和法規；負責水路運輸市場的巨觀調控和信息引導，組織編制下達包括指令性和指導性的水路運輸計畫；負責從事水路運輸（包括港口碼頭、運輸服務業）的單位和個人資質的審核上報，並對其經營行為進行監督；負責對水運運價和水運服務業收費情況的監督檢查，管理髮放各種水運票證，依法徵收有關交通規費；負責全社會對水運運輸船舶的運力、運量等行業統計工作；協調地區之間的水路運輸管理關係，會同有關部門對跨地區水運運輸許可證和營運證的審校工作；會同有關部門管理水路運輸市場，負責水路運輸市場監督檢查和獎懲，維護運輸市場秩序，保護旅客、貨主及運輸經營者的合法權益；負責組織培訓水運業、水運服務業、港口碼頭搬運裝卸業有關從業人員和水路運輸管理專業人員；承辦局領導交辦的其他工作。
