靶向PD1/PD-L1通路的虛擬噬菌體展示模型構建與實驗驗證

《靶向PD1/PD-L1通路的虛擬噬菌體展示模型構建與實驗驗證》是依託電子科技大學,由黃健擔任醒目負責人的面上項目。

基本介紹

• 中文名：靶向PD1/PD-L1通路的虛擬噬菌體展示模型構建與實驗驗證
• 依託單位：電子科技大學
• 項目類別：面上項目
• 項目負責人：黃健

項目摘要

噬菌體展示是一種淘選具有特定親和力的多肽或蛋白質的現代分子生物學技術，已廣泛用於生物醫藥相關基礎與套用轉化研究。腫瘤是人類健康的最大威脅；靶向PD1/PD-L1通路的生物藥物淘選是癌症研究的前沿熱點。本項目將在我們長期從事噬菌體展示生物信息學與實驗研究的基礎上，開發肽庫模擬程式；通過二代測序噬菌體展示與多肽晶片實驗，大量獲得PD1、PD-L1拮抗肽；進而採用多種特徵與機器學習方法，構建、最佳化靶向PD1/PD-L1通路的計算淘選模型並對多種虛擬肽庫進行篩選；接著通過分子動力學計算及酶聯免疫、石英晶體微天平、表面電漿共振等實驗對虛擬淘選結果進行多重校驗；最終根據計算與實驗反饋，最佳化整合出線上的虛擬噬菌體展示模式系統，實現PD1、PD-L1拮抗肽的低成本、高效率獲取。該研究可望建立一種新的計算機輔助生物藥物淘選研究範式，具有重要的科學意義；淘到的多肽可望開發為抗腫瘤新藥，具有廣泛的套用前景。

結題摘要

噬菌體展示是一種淘選具有特定親和力的多肽或蛋白質的現代分子生物學技術，已廣泛用於生物醫藥相關基礎與套用轉化研究。腫瘤是人類健康的最大威脅；靶向PD1/PD-L1通路的生物藥物淘選是癌症研究的前沿熱點。本項目將在我們長期從事噬菌體展示生物信息學與實驗研究的基礎上，開發肽庫模擬程式；通過二代測序噬菌體展示與多肽晶片實驗，大量獲得PD1、PD-L1拮抗肽；進而採用多種特徵與機器學習方法，構建、最佳化靶向PD1/PD-L1通路的計算淘選模型並對多種虛擬肽庫進行篩選；接著通過分子動力學計算及酶聯免疫、石英晶體微天平、表面電漿共振等實驗對虛擬淘選結果進行多重校驗；最終根據計算與實驗反饋，最佳化整合出線上的虛擬噬菌體展示模式系統，實現PD1、PD-L1拮抗肽的低成本、高效率獲取。該研究可望建立一種新的計算機輔助生物藥物淘選研究範式，具有重要的科學意義；淘到的多肽可望開發為抗腫瘤新藥，具有廣泛的套用前景。