雄雄寺是藏地“香巴噶舉”派的祖寺。創始人“瓊波南覺”是該寺廟的創建者。
雄雄寺是藏地“香巴噶舉”派的祖寺。寺廟的創建者、也是這一教派的創始人“瓊波南覺”（約900—1140年），他多次到印度求法，對他最有影響的是兩位女性。一位是號稱空行母的尼古瑪，她傳授了後來成為香巴噶舉派基本大法的“尼古六法”，瓊波南覺就是在“尼古六法”的基礎上，創立了不同於藏傳佛教其他教派的香巴噶舉派；另一位是瓊波南覺的女上師蘇喀斯迪。
瓊波南覺最初在拉薩河一帶建造了一座小寺。但直到他西行到了香曲河流域，建造了以雄雄寺為首的108座寺廟以後，才名聲大噪。後來人們尊稱他為“喇嘛香巴”，而他所創立的教派，也因為根據地在香曲河流域，故稱為“香巴噶舉派”。
後來，香巴噶舉派以南木林為中心。在傳承了七代之後，它分裂出兩個世系，其中一位香巴噶舉派弟子，在今天的羊卓雍錯附近，修建了桑頂寺，形成香巴噶舉派的“桑頂”世系。此後香巴噶舉派還出現了一位大師“湯東傑布”，他以在藏地各處大江大河上修築鐵索橋而聞名。同時，他也是藏戲的始祖，他所創立的藏戲，藏名稱為“阿吉拉姆”，“阿吉”是大姐或女性的意思，“拉姆”意為“仙女”。
