食品科學與工程學院是錦州醫科大學所屬二級教學單位，有碩士研究生和普通本科教育兩個辦學層次。現有食品科學與工程一級學科碩士點1個，涵蓋食品科學，農產品加工及貯藏工程，糧食、油脂及植物蛋白工程，水產品加工及貯藏工程四個二級學科，已形成了肉品加工與質量控制、食品營養與安全、食品活性成分與功能性食品、農產品精深加工與綜合利用四個穩定的研究方向。
近年來，學院高度重視教學、學科、科研工作，學院現任教師中，具有博士學位的教師占教師總數的70%，教師學歷高、梯隊合理、科研能力強、教學經驗豐富。近年來，先後承擔省部級以上科研項目26項，在國內外學術刊物上發表論文600餘篇，其中21篇被SCI收錄，出版國家規劃教材40餘部，有省級精品課程1門，承擔國家級教學改革項目8項，申報獲得發明專利8項，多次獲省部級以上科研、教學成果獎勵。2013年“食品科學與工程專業”獲批遼寧省普通高等學校本科工程人才培養模式改革試點專業。我院的“食品科學與工程專業”在2013年全省14個擁有該專業的本科院校中開展的綜合評價排名第三。
學院現有遼寧省畜產品質量與安全重點實驗室1個、遼寧省肉類加工與質量安全控制工程研究中心1個，是遼寧省畜牧獸醫學會無公害肉類學分會、遼寧省食品科學技術學會副理事長單位。學院積極開展學術交流與國際合作，並與英國諾桑比亞大學在互派留學生、專家、學者及開展教學、科研等方面建立了長期的合作關係，現已向該校輸送留學生8人。
學院下設綜合實驗教學中心1個，下含12個子實驗室，三個校內實踐教學基地（肉製品加工生產線、乳製品加工生產線、農產品加工生產線）。同時學院還與省內外20餘家大中型食品企業簽訂了校企合作協定，建立了校外教學實習基地，為本學科實踐教學提供了強有力的保障。近年來，畢業生多在食品企業、商檢、衛生防疫、科研院所等領域就業，近三年平均就業率達到了98.5%，並受到用人單位一致好評。
