重慶市人口和計畫生育科學技術研究院計畫生育醫學與司法鑑定所作為研究院履行全市計畫生育鑑定服務職能的一個業務部門，主要開展全市病殘兒、計畫生育手術併發症、生育能力和成人傷殘等級的醫學鑑定；承擔全市計畫生育醫學與司法鑑定工作的委託鑑定；開展醫學遺傳與再生育家庭的優生諮詢和相關領域科研工作。
醫學鑑定所現有工作人員8名，其中專職從事鑑定工作人員6名（正高職稱2人、副高職稱4人）。該所創新運行病殘兒"縣級初篩、市級鑑定"工作模式，嚴格按照鑑定規範、鑑定標準和政策規定，堅持公平、公開、公正原則，以良好工作作風、過硬的技術開展鑑定工作，自2003年至2016年9月，開展病殘兒醫學鑑定、計畫生育手術併發症鑑定、生育能力鑑定共35992人次，無一例有效投訴。以此為依託，有效建立了病殘兒鑑定信息庫，完善了鑑定信息查詢、監測和諮詢網路系統，為再生育家庭優生優育提供科學技術指導，為政府落實再生育政策、特別扶助制度和計畫生育行政執法提供了技術支撐。
