鄭基深，中國科學技術大學，微尺度物質科學國家研究中心，研究員。獲得中國科學技術大學的本科和博士學位，清華大學博士後，曾為中科院強磁場中心副研究員。主要研究方向是膜蛋白重構與調控，通過發展可脫除骨架修飾（RBM，Removable Backbone Modification）策略，完成了一系列重大疾病密切相關的中小型功能膜蛋白體外重構，並通過鏡像噬菌體篩選等異種蛋白質工程技術（Xenoprotein engineering），發現新的膜蛋白探針和活性分子/藥物前體分子。
基本介紹
- 中文名：鄭基深
- 國籍：中國
- 民族：漢族
- 出生地：廣西桂林
- 職業：研究員
- 畢業院校：中國科學技術大學
- 學位/學歷：博士
- 專業方向：化學生物學
- 職務：研究員
- 所獲榮譽：清華大學優秀博士後
人物介紹,個人經歷,研究興趣,論文作品,發明專利,科研項目,
人物介紹
微尺度物質科學國家研究中心 分子與細胞生物物理研究部 研究員
中國科學技術大學 生命科學學院 研究員
2002年至2012年就讀於中國科學技術大學化學與材料科學學院，獲得理學學士和博士學位。2012年至2014年在清華-北大生命科學聯合中心從事博士後研究，2014年任中國科學院強磁場科學中心副研究員。2016年起任中國科學技術大學生命科學學院特任研究員。
主要研究方向是膜蛋白重構與調控。以重要生物學問題和重大疾病密切相關的膜蛋白為研究對象，發展可脫除主鏈骨架修飾策略，結合蛋白質化學合成技術，實現一系列具有生物活性的中小型膜蛋白體外重構，例如定點翻譯後修飾、定點同位素標記等功能化膜蛋白體外重構。同時，基於鏡像篩選技術發現新的活性分子/藥物前體分子，發展靶向膜蛋白的蛋白質探針工具，結合現代生物化學和生物物理技術，闡釋跨膜蛋白結構-功能機制，實現膜蛋白功能的精確調控。在Nature Commun、Nature Protocols、J Am Chem Soc、Angew Chem Int Ed和Acc Chem Res等國際高水平雜誌發表（共同）第一作者、（共同）通訊作者論文30餘篇。
個人經歷
受教育經歷：
2002/09 - 2006/07，中國科學技術大學，化學，學士，導師：郭慶祥教授
2006/09 - 2012/07，中國科學技術大學，有機化學，博士，導師：郭慶祥教授
研究工作經歷：
2012/07 - 2014/02，清華大學，化學系，博士後（合作導師：劉磊教授）
2014/03 -2016/07，中國科學院強磁場科學中心，副研究員
2016/07-至今，中國科學技術大學，生命科學學院，研究員
研究興趣
1、功能膜蛋白離體重構的新方法發展
2、功能膜蛋白在體調控的多肽/蛋白探針工具發明
3、基於鏡像蛋白篩選技術的活性分子/藥物前體分子發現
論文作品
1. Guo, Q. Y.; Zhang, L. H.; Zuo, C.; Huang, D. L.; Wang, Z. A.; Zheng, J. S.*; Tian, C. L.* Channel activity of mirror-image M2 proton channel of influenza A virus is blocked by achiral or chiral inhibitors. Protein Cell 2018.
2. Tang, S.; Liang, L. J.; Si, Y. Y.; Gao, S.; Wang, J. X.; Liang, J.; Mei, Z.; Zheng, J. S.*; Liu, L.* Practical Chemical Synthesis of Atypical Ubiquitin Chains by Using an Isopeptide-Linked Ub Isomer. Angew. Chem. Int. Ed. 2017, 56, 13333-13337.
3. Tang, S.; Zuo, C.; Huang, D. L.; Cai, X. Y.; Zhang, L. H.; Tian, C. L.*; Zheng, J. S.*; Liu, L.* Chemical Synthesis of Membrane Proteins via the Removable Backbone Modification Method. Nature Protocols2017, 12, 2554-2569.
4. Li, J. B.; Tang, S.; Zheng, J. S.*; Tian, C. L.*; Liu, L.* Removable Backbone Modification Method for the Chemical Synthesis of Membrane Proteins. Acc. Chem. Res. 2017, 50, 1143-1153.
5. Li, J.; He, Q.; Liu, Y.; Liu, S.; Tang, S.; Li, C.; Sun, D.; Li, X.; Zhou, M.; Zhu, P.; Bi, G.; Zhou, Z.; Zheng, J.-S.*; Tian, C.* Chemical Synthesis of K34-Ubiquitylated H2B for Nucleosome Reconstitution and Single-Particle Cryo-Electron Microscopy Structural Analysis. ChemBioChem2017, 18, 176-180.
6. Zheng, J.-S.; He, Y.; Zuo, C.; Cai, X. Y.; Tang, S.; Wang, Z. A.; Zhang, L.-H., Tian, C.-L.*; Liu, L.* Robust Chemical Synthesis of Membrane Proteins through a General Method of Removable Backbone Modification. J. Am. Chem. Soc. 2016, 138, 3553-3561.
7. Zuo, C.; Tang, S.; Si, Y.-Y.; Wang, Z. A.; Tian C.-L.; Zheng J.-S.* Efficient synthesis of longer Aβ peptides via removable backbone modification. Org. Biomol. Chem. 2016, 14, 5012-5018.
8. Qi Y.-K.; Tang S.; Huang Y.-C.; Pan M.; Zheng J.-S.*; Liu, L.* Hmb(off/on) as a switchable thiol protecting group for native chemical ligation. Org. Biomol. Chem.2016, 14, 4194-4198.
9. Chen, X. Tang, S.; Zheng, J. S.; Zhao, R.; Wang, Z. P.; Shao, W.; Chang, H. N.; Cheng, J. Y.; Zhao, H.; Liu, L.*; Qi, H.* Chemical Synthesis of a Two-Photon-Activatable Chemokine and Photon-Guided Lymphocyte Migration in vivo. Nat. Commun. 2015, 6, 7220-7228.
10. Qi Y.-K.; Chang H.-N.; Pan K.-M.; Tian C.-L.; Zheng J.-S.* Total Chemical Synthesis of the Site-Selective Azide-Labeled [I66A]HIV-1 Protease. Chem. Commun. 2015, 51, 14632.
11. Zheng, J.-S.; Yu, M.; Qi, Y.-K.; Tang, S.; Shen, F.; Wang, Z.-P.; Xiao, L.; Zhang, L.; Tian, C.-L.*; Liu, L.* Expedient Total Synthesis of Small to Medium-Sized Membrane Proteins via Fmoc Chemistry. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 3695-3704.
12. Zheng, J.-S.; Tang, S.; Qi, Y.-K.; Wang, Z.-P.; Liu, L.* Chemical Synthesis of Proteins Using Peptide Hydrazides as Thioester Surrogates.Nat. Protoc.2013, 8, 2483-2495.
13. Zheng, J.-S.; Tang, S.; Huang, Y.-C.; Liu, L.* Development of New Thioester Equivalents for Protein Chemical Synthesis. Acc. Chem. Res.2013, 46, 2475–2484.
14. Zheng, J.-S.; Chang, H.-N.; Wang, F.-L.; Liu, L.* Fmoc Synthesis of Peptide Thioesters without Post-Chain-Assembly Manipulation. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 11080-11083.
發明專利
1. 一種化合物及其製備方法及利用其製備多肽的方法。發明人：鄭基深、唐姍、司岩岩、劉磊、田長麟。中國專利授權公告號：CN 104744327 A。
2. 化合物及其製備方法和套用。發明人：劉磊、鄭基深、左超、唐姍、田長麟。中國專利申請號：CN 105622424 A。
科研項目
1. 國家自然科學基金重大研究計畫培育項目，91753120，2018/01-2020/12，主持
2. 國家自然科學基金大科學裝置聯合基金項目，U1732161，2018/01-2020/12，主持
3. 安徽省傑出青年科學基金，蛋白質化學修飾的化學生物學，2018/07-2021/06，主持
4. 合肥物質科學技術中心方向項目培育基金，2017FXCX002，2018/01-2019/12，主持
