運籌學在生物信息學若干問題上的套用

運籌學在生物信息學若干問題上的套用

《運籌學在生物信息學若干問題上的套用》是依託中國科學院數學與系統科學研究院,由章祥蓀擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:運籌學在生物信息學若干問題上的套用
  • 項目類別:面上項目
  • 項目負責人:章祥蓀
  • 依託單位:中國科學院數學與系統科學研究院
  • 批准號:10471141
  • 申請代碼:A0405
  • 負責人職稱:研究員
  • 研究期限:2005-01-01 至 2007-12-31
  • 支持經費:24(萬元)
項目摘要
隨著基因組學和蛋白質組學研究的逐步深入,生物信息學面臨的挑戰性問題越來越多,對大規模數據的處理和利用,對具NP-hard本質的生物學模型的解算,已是生物信息學研究的瓶頸,成為全球科學家特別是運籌學家關注的問題。本課題研究的幾個主要內容均屬於這一範疇,即具有生物學背景,用到生物學數據,又是運籌學中的困難問題:(1)雜交測序法所得數據的重組計算;(2)利用單體型對單核苷酸多態性研究中的快速最佳化算法;(3)通過數據壓縮提煉蛋白質結構特徵並生成新的資料庫。涉及的運籌學分支為組合最佳化與圖論、數學規劃、動態規劃、人工神經網路和馬氏鏈等。這些研究內容的意義在於,它們是當前生物學和生物信息學研究的重點,得到的算法將為生物學家使用並有助於增強對生物問題本身的理解(例如蛋白質結構的要素),同時對運籌學的研究也會起到推動作用。近十年來的國際生物信息學研究已經表明,生物信息學研究是近代運籌學發展的重要動力之一。

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