2011年6月，經國家農業部批准，總投資1800萬元的農業部動物疾病臨床診療技術重點實驗室在內蒙古農業大學成立。
成立農業部動物疾病臨床診療技術重點實驗室旨在加強對動物疾病（特別是普通病和感染性疾病）的研究和防治，充分發揮我校的區位優勢和人才優勢，建立一個動物疾病診療技術研究、防治的平台，解決上述突出問題，使動物疾病診療與防治工作儘快適應畜牧業生產和相關產業快速發展的需要。使其成為在動物疾病臨床診療技術領域人才培養、科學研究、社會服務、技術推廣等方面的重要基地。
農業部動物疾病臨床診療技術重點實驗室主要圍繞“突破一批農業套用基礎研究的關鍵性難題，發展一批農業重點學科和新興學科，造就一批高水平的學術帶頭人”三大任務，開展家畜普通疾病診斷與治療技術、動物感染性疾病病原生物學、獸藥殘留殘留檢測技術等方面的研究，努力建立全面完整切實可行的動物疾病臨床診療技術體系；重視無殘留、無污染、符合動物性食品安全的新型藥品的研製與開發，突破我國動物疾病臨床各項檢測、監測和診療方面的關鍵性技術難題，開拓家畜疾病臨床診療的新思路和新途徑，提出系列家畜疾病診斷、防控的新理論和新策略。
農業部動物疾病臨床診療技術重點實驗室的建設，可以在很大程度上解決畜牧業生產中的諸多難題，為畜牧業的健康、快速發展提供保障，為農牧民增產增收保駕護航。
