贛州市畜牧研究所創建於1963年8月，是副縣級科研事業單位，隸屬於贛南科學院。主要從事畜禽良種繁育推廣、飼料、獸藥新產品研製，動物疾病防治技術研究，畜產品加工技術研究及畜牧套用技術推廣服務工作。
1984年以來共取得部、省級和市級科研成果80餘項。獲國家發明專利3項，多項科研成果獲省、市科技進步獎，其中“贛州白豬的培育”獲農業部和江西省科技進步二等獎，“蚓體複合胺基酸提取方法”、“蚓體SOD提取及系列保健食品的生產”、“獸用長效抗痢靈混懸液的生產”獲國家發明專利，“高效育肥板鴨料”、“南安板鴨外五件”、“帝龍天然SOD酒”，“科明SOD膠囊”、“綠色飼料添加劑－促轉素”等產品獲國家、省、市行業優秀新產品。
所內建有農業部定點動物防疫基礎設施中心實驗室、江西省實驗動物（兔）生產繁育基地、贛南肉用種兔繁育基地、贛州市畜牧研究所院士工作站、豬糞高值化綜合利用技術示範基地、生態雞養殖示範基地、蚯蚓養殖試驗示範基地、贛州市現代畜牧科技示範園暨贛州市畜牧研究所中試與產業基地等；是江西省農業科研創新聯盟成員單位，2015年被確立為江西省現代農業產業技術體系生豬產業贛南山區綜合試驗站；2016年被列為水禽產業技術體系贛南綜合試驗站。
