貸款核算手續審計是指以有關制度、規定為依據，對各種貸款核算方式及手續的合法性、合理性和合規性進行的審計。審計主要內容是：（1）審查貸款核算手續是否符合貸款原則，是否適應不同類型的貸款，是否有利於及時反映信貸計畫執行情況；（2）審查貸款單位條件、借款契約、貸款監督、帳戶設定等方面是否符合基本規定；（3）審查逐步核貸方式的核算手續，如貸款是否逐筆申請立據、逐筆發放；帳據是否相等，借據保管是否完整；有無逾期未轉的借據；貸款轉移，並、轉單位是否有換立借據、更換戶名的手續；收回貸款時，其收回的借據是否註銷記帳，利隨本清的借款是否計收利息。（4）審查活收活放貸款的核算手續，如是否採取限制使用的方針；應分戶的，是否已作出存貸分戶的安排；新採用的單位是否有特殊的規定和批件，是否嚴格控制存貸合一帳戶的付方餘額。（5）審查結算借款的核算手續，如信用證結算貸款的發放是否嚴格控制在提存保證金的數額之內；信用證期滿不再劃款，沖銷信用證保證金的同時，是否及時收回貸款等。（6）審查下貸上轉及上貸下撥貸款核算的手續是否訂立協定或契約，有無下達控制指標，手續是否齊全等。（7）審查票據承兌與貼現業務的核算手續。
