《豬8號染色體影響肌內脂肪含量QTL的遺傳解析》是依託華南農業大學，由楊傑擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：豬8號染色體影響肌內脂肪含量QTL的遺傳解析
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：楊傑
- 依託單位：華南農業大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
豬肌內脂肪(IMF)含量是影響豬肉色澤、口感及加工的重要因素，揭示IMF沉積的分子機制對豬肉品質遺傳改良具有重要意義。通過前期全基因組關聯性分析及連鎖不平衡分析,本項目組在豬8號染色體上發現一個顯著影響IMF含量的QTL（P＜1E-7）,其QTL置信區間為3.37Mb，解釋了杜洛克群體8.1%的表型變異。本項目擬在此基礎上，通過增加標記密度和基於連鎖不平衡的關聯分析精細定位該QTL；進一步利用極端表型個體肌肉組織的轉錄組數據，開展肌肉表達 QTL定位及基因表達量與表型關聯的QTT分析，並構建與IMF含量相關的基因調控網路；進而通過整合系統生物學方法，鑑別8號染色上影響IMF 含量的因果基因；最後，通過細胞功能驗證確定關鍵基因中的因果突變位點。結果不僅將為IMF的複雜遺傳本質提供新的視角，而且有益於杜洛克及其合成系的肉質性狀遺傳改良。
結題摘要
豬肌內脂肪(IMF)含量是影響豬肉品質的關鍵因素，鑑別影響IMF沉積的關鍵基因及突變對豬肉品質遺傳改良至關重要。採用全基因組關聯分析，本項目首次將豬8號染色體上影響肌內脂肪含量的QTL的置信區間由3.27Mb縮小至1.24Mb，並鑑別到ZDHHC16、 LOC102162218 及 PCDH7三個基因極可能是豬8號染色體上影響肌內脂肪含量的關鍵基因。進一步通過擴大群體規模及新增3種不同的多標記統計分析模型（MrMLM、FASmrEMMA和ISIS EM-BLASSO），本研究最終在整個基因組上鑑別到28個顯著的SNPs與肌內脂肪含量相關，並推測出BDKRB2、GTF2IRD1、UTRN、TMEM138、DPYD、CASQ2、ZNF518B、S1PR1、GPC6和GLI1這10個基因可能是影響肌內脂肪的候選基因。本項目不僅為肌內脂肪的複雜遺傳本質提供新的視角，而且獲得了2項具備潛在育種價值的分子標記（已獲國家發明專利授權），上述標記可直接套用於杜洛克及其合成系的肉質性狀遺傳改良。
