為順應當今社會信息技術和現代教育技術的發展，構建數位化校園和教育信息化體系，建立更加專業的機構和隊伍，學院在2016年機構改革中，將現代教育技術中心與生物醫學工程系合併，將技術保障技術服務的教輔職能和教學職能進行整合，在現代教育技術中心和生物醫學工程系的基礎上成立了醫學信息與工程學院，實行醫學信息與工程學院·現代教育技術中心兩塊牌子一套人馬的運行機制。現代教育技術中心是以信息技術和現代教育技術套用為核心，以技術服務技術保障為手段，以突出輔助教學工作為重點，為構築高水平、高效率的教學平台，推進校園數位化、教育信息化進程的技術保障和教學輔助部門。
在學院黨政的領導下，現代教育技術中心負責校園網整體規劃與建設、資源配置、運行維護和安全管理，建設和維護WWW、Email等各類基礎信息服務系統，為學院教學、科研、管理等套用系統提供基礎平台建設和技術保障；負責學院主頁的建設、管理和維護以及各類專題網站和二級網站建設的技術服務和指導工作；負責全院教室管理、教室多媒體設備技術支持和保障、CAI課件製作、瀘醫要聞拍攝、編輯和製作、教師多媒體設備使用培訓、課件製作培訓。利用現代教育技術，積極協助院系開展精品課程建設工作，為廣大教師製作高質量的多媒體教學課件和教學資源提供支持，並在全院範圍開展現代教育技術和網路套用技術的推廣和培訓工作。配合宣傳部、各職能部門，利用校園網及時宣傳報導了學院各項重要會議、各項重大活動。
