西伯利亞國立交通大學成立和發展的歷史與為國家提供鐵路工程人才是分不開的。1932年將托木斯克技術學院一個系改建為鐵路工程建築學院,即西伯利亞國立交通大學的前身。1953年以前學校一直是全國惟一專門培養軍事運輸工程人員的大學,二戰前該學院為國家培養了1147名工程技術人員,其中300人獲得了學位證書。1953年學院改為新西伯利亞鐵路運輸工程學院,到80年代它已經成為西伯利亞的一個重要教學中心。1997年學院升格為交通大學。學校有學生有9403人,研究生171人,博士生6人。
西伯利亞國立交通大學設有10個系:鐵路建設系、建築汽車和運輸汽車系、橋樑和隧道系、鐵路運輸管理系、工程經濟系、商業信息學系、工業和國民建設系、世界經濟與法學系、人事管理系、還有函授系,主要專業有:勘查、設計、建築鐵路、汽車公路、鐵路幹線、工業鐵路運輸、工程大地測量學、隧道與地下鐵道地下室等。