《複雜疾病中剪接相關的外顯子分子邏輯挖掘方法的研究》是依託中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院，由杭興宜擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：複雜疾病中剪接相關的外顯子分子邏輯挖掘方法的研究
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：杭興宜
- 依託單位：中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
近年來以心腦血管疾病、惡性腫瘤、糖尿病等為代表的複雜疾病已經成為人類的致命殺手，嚴重影響人類健康和社會發展。由於複雜疾病的致病機理是基因-遺傳-環境等多種因素交錯的非線性關係，而且事實已證明以往基於單個基因的研究模式難以真正揭示複雜疾病的分子機制，因此採用高通量數據和系統生物學方法研究複雜疾病已漸次成為該領域的迫切需求。本課題擬在建立全新的外顯子晶片(Exon array)數據分析平台的基礎上，基於資訊理論中的分子邏輯方法，深化並擴展傳統的基因網路系統生物學的範疇，分層並互動利用基因和外顯子表達數據研究與異常剪接相關的複雜疾病中的外顯子分子邏輯關係，力求發現以基因為載體的外顯子功能模組，並通過功能注釋挖掘這些模組和複雜疾病表型之間的關係。進而以申請者所在實驗室產出的腦中風模型的外顯子晶片數據為挖掘對象，發現腦中風相關的外顯子分子邏輯，為此類疾病的診斷和治療提供線索。
結題摘要
心腦血管疾病、惡性腫瘤、糖尿病等複雜疾病已經成為導致人類健康問題的致命因素，嚴重影響人類健康和社會發展。以往的研究表明，基於單個基因的研究模式難以真正揭示複雜疾病的分子機制，因此採用高通量數據和系統生物學方法研究複雜疾病已漸次成為該領域的迫切需求。本課題在建立全新的外顯子晶片(Exon array)數據分析平台的基礎上，從資訊理論中的分子邏輯方法出發，同時發展利用基於實驗的驗證方法，從功能和蛋白質結構域等多個層次分析了小鼠缺血再灌注過程中參與的可變剪接事件之間的分子邏輯關係，發現一些與缺血再灌注過程相關的重要外顯子功能模組，並通過功能注釋證明了這些模組和腦中風表型之間的關係。同時，我們還通過建立一系列基於RT-PCR的實驗設計和驗證體系，對預測得到的重要可變剪接事件進行實驗驗證，保證了數據分析的可靠性。因此，我們在該項目中的研究結果將為人類腦中風疾病的診斷和治療提供有意義的參考和線索。
