袁哲明

男，1971年9月生，湖南嶽陽人，漢族，中共黨員。湖南農業大學生物安全科學技術學院副院長，教授，博士生導師，生物信息學碩士點領銜人。

現任湖南農業大學植物保護學院教授

基本介紹

• 中文名：袁哲明
• 國籍：中國
• 民族：漢族
• 出生地：湖南嶽陽
• 出生日期：1971年9月
• 職業：教授
• 畢業院校：浙江大學
• 學位/學歷：博士
• 專業方向：生物信息學、複雜數據分析 
• 政治面貌：中共黨員

人物介紹

袁哲明，男，1971年9月生，湖南嶽陽人，漢族，中共黨員。2003年獲湖南省優秀博士後，2006年入選教育部新世紀優秀 人才支持計畫、遴選為博士生導師並破格晉升為教授，2010年入選湖南省新世紀人才工程人選，2011年入選湖南省傑出青年基金與湖南省學科帶頭人培養對象。現為湖南農業大學植物保護學院教授、生物信息學博士點領銜人、校學術委員會委員；湖南省農業大數據分析與決策工程技術研究中心主任、湖南省生物信息學會副理事長。

研究方向

主要從事生物信息學、複雜數據分析等研究。

個人履歷

1996年赴澳大利亞昆士蘭大學進修，2004年獲湖南省優秀博士後稱號，2005年遴選為湖南省教育廳青年骨幹教師培養對象，2006年入選教育部新世紀優秀人才支持計畫，2010年入選湖南省新世紀121人才，2011年入選湖南省學科帶頭人培養對象。早期主要從事昆蟲病毒分子生物學研究，2005年起主要從事複雜生物數據分析、生物信息學研究。

先後主持國家自然科學基金2項，教育部新世紀優秀人才項目、省傑出青年基金、省教育廳重點項目各一項、教育部博士點基金2項，其他課題多項。第一作者或通訊作者發表論文128篇，其中SCI論文47篇。主持、參與獲國家科技進步二等獎(9)、教育部科技進步二等獎(15)、省自然科學三等獎(1)、省科技進步三等獎(6)各一項。

導師聘期考核屢次優秀。指導研究生獲全國研究生數模競賽二等獎2項、三等獎2項，省研究生數模競賽一等獎一項、三等獎2項，共7項21人次；獲校優博士論文2篇，省優碩士論文3篇，校優碩士論文5篇；獲研究生國家獎學金5人次、北美獎學金一人次；指導研究生主持湖南農業大學省優博士論文培育基金一項、省研究生創新項目5項。

受教育經歷

1988/09－1992/06：湖南師範大學，本科

1992/09－1995/06：湖南農業大學，碩士

1996/09－2000/06：浙江大學，博士

2000/09－2002/10：湖南農業大學，博士後

研究工作經歷

2006/10—，湖南農業大學，生安院生物信息系，教授

2002/10－2006/09，湖南農業大學，植保學院昆蟲系，副教授

1997/10－2002/09，湖南農業大學，植保學院昆蟲系，講師

1995/09－1997/09，湖南農業大學，植科院植保系，助教

研究方向

（1）創新的高維特徵選擇算法及其在生物晶片數據上的套用。發展了一系列高維特徵選擇算法，套用於癌基因晶片數據、全基因組關聯數據、蛋白質組質譜數據和DNA甲基化數據分析並進行整合，較大幅度提升複雜疾病數據解析能力。

（2）多因素多水平配方、工藝最佳化試驗設計與分析。以F測驗對支持向量回歸（SVR）建立一套合理、完整的解釋性體系，解決SVR可解釋性差的弊端；進一步結合SVR和均勻設計（UD），提出一種試驗次數少、最佳化高效、預測精度高、可解釋性強的多因素多水平試驗設計與分析方法UD-SVR，成功套用於多肽定量序效模型構建，高活性抗菌肽的分子設計與合成等計算機輔助藥物設計相關重要課題。

（3）多尺度組分與關聯法的創建及其在生物信息學中的套用。以支持向量分類（SVC）為主要工具，以自舉創建的分子序列特徵提取方法—多尺度組分與關聯法為核心，結合高維地統計學和Logistic回歸或貝葉斯統計推斷，對生物信息學中諸如計算機基因識別、蛋白質相互作用、蛋白質亞細胞定位等分類領域開展研究。

（4）基於地統計學（GS）和SVR的非線性回歸分析研究。對縱向數據，以一維地統計學定階轉化為非縱向數據。對非縱向數據，以高維地統計學公共變程解決最優K近鄰選擇難題，實現個體化預測，在降低計算複雜度的同時提升預測精度。嘗試將其廣泛套用於定量構效關係（QSAR）、定量序效關係、多維時間序列分析等領域。

（5）高聚物的大生物降解。以聚苯乙烯、聚氯乙烯等高聚物為對象，研究一種大生物對其降解效能，闡明其降解機理，探索治理“白色污染”的可能新途徑。

成就及榮譽

2004年獲湖南省優秀博士後稱號

2005年遴選為湖南省教育廳青年骨幹教師培養對象

2006年入選教育部新世紀優秀人才支持計畫

2010年入選湖南省新世紀121人才

2011年入選湖南省學科帶頭人培養對象。

先後主持國家自然科學基金、教育部新世紀優秀人才支持計畫項目、教育部博士點基金、湖南省傑出青年基金、湖南省自然科學基金等課題多項

第一作者或通訊作者發表論文106篇，其中SCI論文17篇，一級學報論文42篇

參與獲國家科技進步二等獎（排名8）、教育部科技進步二等獎（排名15）、湖南省科技進步三等獎（排名7）等各一項。

主要論著

[1] Haiyan Wang, Hongyan Zhang, Zhijun Dai,Ming-shun Chen,Zheming Yuan*.TSG: a new algorithm for binary and multi-class cancer classification andinformative genes selection.BMC MedicalGenomics, 2013, 6(Suppl 1):S3 (SCI,IF=3.69)

[2] Hongyan Zhang, Haiyan Wang, Zhijun Dai, Ming-shun Chen,Zheming Yuan*. Improving Accuracy for Cancer Classification with a New Algorithm for Genes Selection. BMC Bioinformatics,2012, 13: 298(SCI, IF=2.75)

[3] Wei Zhou, Zhijun Dai,Yuan Chen , Haiyan Wang andZheming Yuan*.High-Dimensional Descriptor Selection and Computational QSAR Modeling forAntitumor Activity of ARC-111 Analogues Based on Support Vector Regression(SVR).Int. J. Mol. Sci. 2012, 13,1161-1172 (SCI, IF=2.60)

[4] Jinliang Li, Lifeng Wang, Haiyan Wang, LianyangBai,Zheming Yuan*. High-AccuracySplice Sites Prediction Based on Sequence Component and Position Features.Genetics and Molecular Research, 2012,11(3): 3432-3451 (SCI)

[5] QIAN Gang, WANG Hai-Yan ,YUAN Zhe-Ming*.Using homology information from PDB to improve the accuracy ofprotein β-turn prediction by NetTurnP.Progressin Biochemistry and Biophysics. 2012, 39(5): 472-482 (SCI)

[6] LI-FENG WANG, XIAN-SHENG TAN, LIAN-YANG BAI,ZHE-MING YUAN*. Establishingan Interpretability System for Support Vector Regression and Its Application inQSAR of Organophosphorus Insecticide.AsianJournal of Chemistry, 2012, 24(4): 1575-1578 (SCI)

[7] WANG Zhi-Ming, HAN Na,YUAN Zhe-Ming*, WU Zhao-Hua. Feature Selection for High-dimensionalData Based on Ridge Regression and SVM and Its Application in Peptide QSARModeling.Acta Physico-Chimica Sinica,2013,29(3):498-507 (SCI)

[8] Wei Zhou, Zhijun Dai, Yuan Chen,Zheming Yuan*.Computational QSAR models with high-dimensional descriptor selection improveantitumor activity design of ARC-111 analogues.Medicinal Chemistry Research, 2013, 22(1): 278-286(SCI)

[9] SU Man-Xiu, WANG Li-Feng, DAI Zhi-Jun,YUANZhe-Ming*, BAI Lian-Yang.Primary StructuralCharacterizations of Polypeptide and Antimicrobial Peptides QSAM Modeling.Chemical Journal Of Chinese Universities,2012, 33(11): 2526-2531 (SCI)

[10] DAI Zhi-Jun, ZHOU Wei,YUAN Zhe-Ming*. A Novel Method of Nonlinear RapidFeature Selection for High Dimensional Data and Its Application in Peptide QSARModeling Based on Support Vector Machine.ActaPhys. Chim. Sin., 2011, 27(7): 1654-1660 (SCI)

[11] Changsheng Xiang, Wei Zhou,Zheming Yuan*, Yuan Chen,Xingyao Xiong. A new parameters joint optimization method of chaotic timeseries prediction. International Journal of the Physical Sciences，2011, 6(10): 2565-2571

[12] YUAN Zhe-ming*, TANXian-sheng. Nonlinear Screening Indexes of Drought Resistance at Rice SeedlingStage Based on Support Vector Machine.ActaAgronomica Sinica, 2010, 36(7): 1176-1182

[13] 李俊,譚顯勝,譚泗橋,袁哲明*,熊興耀.改進支持向量機在棉鈴蟲人工飼料配方最佳化中的套用.昆蟲學報, 2010, 53(4): 420-426.

[14] 周世豪,李俊,姚潤賢,張星,袁哲明*.基於均勻設計與支持向量回歸的棉鈴蟲幼蟲全純人工飼料配方最佳化.昆蟲學報, 2012, 55(1): 124-132.

[15] 譚顯勝,王志明,李蘭芝,袁哲明*.基於支持向量回歸的棉鈴蟲發育歷期估測.昆蟲學報, 2011, 54(1): 83-88.

[16] 王志明,譚顯勝,周瑋,袁哲明*.基於支持向量回歸的生物測定數據分析.昆蟲學報, 2011, 53(12): 1436-1441.

[17] 陳淵,豐鋒,袁哲明*.改進支持向量分類用於七種蝶類自動鑑別.昆蟲學報, 2011, 54(5)：609-614.

[18] 袁哲明*,譚顯勝.基於支持向量機非線性篩選水稻苗期抗旱性指標.作物學報, 2010, 36(7): 1176-1182

[19] 王志明,譚顯勝,袁哲明*.自調用支持向量回歸和偏最小二乘最佳化支持向量機參數.小型微型計算機系統, 2010, 31(9): 1815-1819.

[20] 向昌盛,袁哲明*,周子英.混沌時間序列預測模型參數的聯合最佳化.信息與控制, 2011, 40(5): 673-679.

[21] 王志明,譚顯勝,袁哲明*.自調用支持向量回歸最佳化支持向量機參數.系統仿真學報, 2010, 22(2): 376-378.

[22] 蔡柳,譚顯勝,袁哲明,蘇小軍,張婷婷,李清明,熊興耀.木薯生料發酵轉化乙醇的工藝參數最佳化研究.中國農學通報. 2010, 26(20): 406-412.

[23] 李星,陳淵,張永生,袁哲明*.基於支持向量回歸與地統計學的多維時間序列分析.中國農學通報. 2011, 27(29): 133-138.

[25] Li-fengWANG, Xian-sheng TAN,Zhe-ming YUAN*,Lian-yang BAI. A Novel QSAR Combination Forecast Model forInsect RepellentBased on Support VectorRegression and K-Nearest-Neighbor.Journalof the Chemical Society ofPakistan.Accepted (SCI)

[24] 袁哲明,第十章統計學習推理,見:陳銘主編,生物信息學(十二五規劃教材),北京:科學出版社, 2012, 215-248.

[25] 柏連陽,周小毛,王義成,余柳青,劉承蘭,金晨鐘,曾愛平,袁哲明,劉祥英,李富根,王朝暉.水田雜草安全高效防控技術研究與套用,國務院,國家科學技術進步獎,二等, 2012年