《表觀遺傳因子對大鼠生命周期中多器官基因表達的影響》是依託復旦大學，由石樂明擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：表觀遺傳因子對大鼠生命周期中多器官基因表達的影響
- 依託單位：復旦大學
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：石樂明
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
基因及基因組在不同年齡階段不同器官中的表達與修飾狀態是高等生物生命進程生長發育與衰老的分子基礎，也是功能基因組學研究的基本內容。申請人最近通過對來自幼年、青春期、成年及老年的大鼠進行涵蓋2種性別11種器官共320個樣本的轉錄組深度測序，繪製出迄今最完整的大鼠轉錄組圖譜（Nature Communications, 2014）。為深入認識大鼠基因表達調控的時空特徵，本項目擬⑴基於自有的海量多層次組學數據，構建轉錄組、miRNA和DNA甲基化的多層次圖譜；⑵鑑定不同時空條件下的多層次轉錄調控關係，發現甲基化與miRNA影響大鼠生命進程的重要分子事件，構建大鼠表觀遺傳圖譜；⑶針對重要分子事件進行實驗驗證，評估圖譜可靠性與適用性；⑷創建大鼠表觀遺傳圖譜資料庫，形成公共研究資源。本項目將為闡明表觀遺傳因子的基因調控機制、認識大鼠基因組功能以及更好地利用大鼠進行藥物研發和臨床轉化奠定基礎。
結題摘要
本項目利用已有的組學數據，通過對來自幼年、青春期、成年及老年的大鼠進行涵蓋2種性別11種器官共320個樣本的轉錄組深度測序和miRNA測序，(1)研究大鼠miRNA表觀遺傳表達、轉錄因子和剪接因子圖譜；(2)整合數據，基於不同時空條件下的多層次轉錄調控關係，構建表觀遺傳因子和基因表達的表觀遺傳調控圖譜；(3)挖掘和驗證影響大鼠生命歷程重要的基因表達和表觀調控事件；(4)進一步挖掘與藥物代謝相關的分子事件，幫助了解藥物代謝相關的表達調控機制；(5)構建大鼠基因表達資料庫，便於數據共享。項目培養博士後、博士和碩士研究生總計11名；發表SCI論文11篇，專著1本，申請專利1項，獲得軟體著作權5項。本項目完成了既定研究目標和研究任務，為闡明表觀遺傳因子的基因調控機制、認識大鼠基因組功能以及更好地利用大鼠進行藥物研發和臨床轉化奠定基礎。
