蛋白質譜技術簡單來說就是一種將質譜儀用於研究蛋白質的技術。目前，它的基本原理是蛋白質經過蛋白酶的酶切消化後成肽段混合物，在質譜儀中肽段混合物電離形成帶電離子，質譜分析器的電場、磁場將具有特定質量與電荷比值（即質荷比，M/Z）的肽段離子分離開來，經過檢測器收集分離的離子，確定每個離子的M/Z值。經過質量分析器可分析出每個肽段的M/Z，得到蛋白質所有肽段的M/Z圖譜，即蛋白質的一級質譜峰圖。離子選擇裝置自動選取強度較大肽段離子進行二級質譜分析，輸出選取肽段的二級質譜峰圖，通過和理論上蛋白質經過胰蛋白酶消化後產生的一級質譜峰圖和二級質譜峰圖進行比對而鑑定蛋白質。
基本介紹
- 中文名：蛋白質譜
- 外文名：Protein Mass Spectrometry
一開始，蛋白質譜通過離子化（Electrospray Ionization，ESI）或者基質輔助雷射解吸電離（Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization，MALDI）的方法對完整的蛋白質進行離子化後進入質譜分析儀器，這也被稱為“top-down”蛋白分析方法。後來，完整的蛋白質通過酶切作用後，分解成多肽混合物，這些混合物進入質譜儀後，通過多肽指紋圖譜或串聯質譜的方法進行鑑定，這被稱為"bottom-up"方法。顯然，後者可以從多肽水平實現對蛋白質的分析和鑑定。
右側即是一張蛋白質譜的結果圖。上半張顯示的是各多肽片段的保留時間，下半張顯示的是各質荷比片段的相對豐度。
