《蛋白質分子在固液界面上吸附的分子動力學模擬》是依託天津大學，由韓振為擔任項目負責人的青年科學基金項目。
《蛋白質分子在固液界面上吸附的分子動力學模擬》是依託天津大學，由韓振為擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要考慮分子間相互作用，分子與固體表面之間相互作用，蛋白質分子表面電荷分布，蛋白質分子構象變化等多種因素，進行蛋...
《哈密頓分子動力學模擬方法及其在蛋白質研究中的套用》是依託浙江大學，由鄧茂林擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 基於非線性隨機動力學與控制的哈密頓理論體系,提出與發展新的模擬方法-哈密頓分子動力學模擬方法，並將方法套用於蛋白質...
《分子動力學模擬研究溶液環境對蛋白質構象的影響》是依託南京師範大學，由衛海燕擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 水在蛋白質結構和功能中扮演著至關重要的角色，蛋白質發揮功能不僅僅是通過改變自身構象和運動性實現，還可以通過...
《蛋白質專一性極化力場在分子動力學模擬中的套用》是依託山東師範大學，由段莉莉擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 靜電相互作用是生物分子中最重要的相互作用，但目前分子力場對靜電相互作用的描述都不包含關鍵的靜電極化效應。新...
界面參數 對三種界面參數的情況進行模擬：(1)蛋白質分子與界面之間：εp=100，σp=10，水分子與界面之間：εw=1，σw=10(條件Ⅰ)；(2)蛋白質分子與界面之間：εp=100，σp=5，水分子與界面之間：εw=1，σw=5(條件Ⅱ)：...
圍繞蛋白質層析分離中的分子相互作用，一方面從分子模擬入手，構建分子模擬方法，探討配基－蛋白質間分子相互作用；另一方面從實驗研究入手，製備系列層析分離介質，探討蛋白質吸附性能；在此基礎上，以免疫球蛋白為實際對象，探討分離新方法，...
研究以四肽為配基的仿生層析方法，並將其用於蛋白質藥物的分離純化，首先通過分子對接和分子動力學模擬的手段分析四肽配基與蛋白質分子的相互作用關係，包括胺基酸種類和排序，作為四肽配基篩選和配基設計的主要參考數據；研究層析基質的活化...
蛋白質分子主要通過多個尺度的相互作用和構象漲落行使生物功能。常規分子模擬方法在刻畫蛋白質功能運動時通常會面臨精度/效率瓶頸。例如，全原子分子模擬方法儘管精度較高，但計算效率較差，很難用於模擬時間尺度在微秒以上的蛋白質分子動力學...
建立多組分吸附熱力學、傳質動力學和復性動力學理論模型；最後根據分子模擬和單分子實驗所揭示的界面/表面化學組成和結構對蛋白質結構變化與色譜行為的影響規律，設計新型色譜配基和摺疊助劑，建立新型蛋白質色譜分離和復性方法，實現蛋白質...
本申請項目將以白內障形成的分子機制為研究重點，擬通過粗粒化分子動力學模擬及定標粒子理論計算，研究晶狀體蛋白體系的相分離線、逾滲線、化學活性係數以及滲透壓，以分析蛋白系統出現短程無序性的物理本質。首先，分子模擬研究晶狀體蛋白的...
本課題的主要目標是研究蛋白質分子之間的遠程識別機制，我們將根據蛋白質分子之間遠程靜電相互作用的變化規律，分析蛋白質分子之間的最優對接方向和對接界面，縮小蛋白質複合物構象的搜尋空間，並使用分子動力學模擬的方法研究蛋白質複合物的...
