蘇南環境保護督查中心是江蘇省環境保護廳直屬單位,主要職責為:負責對區域內環境保護工作實施監督檢查;承擔跨區域、流域重大環境糾紛以及重大生態破壞和環境違法案件的調查工作;承擔跨區域、流域以及敏感區域的環境監測工作;承擔對跨區域、流域重大突發環境事件的應急回響工作。