葡萄球菌黃素(英語:Staphyloxanthin)是一種由一些金黃色葡萄球菌菌種製造的類胡蘿蔔素。這種色素給了金黃色葡萄球菌它的顏色。 在葡萄球菌內的作用,注意, 在葡萄球菌內的作用葡萄球菌黃素在金黃色葡萄球菌的感染中扮演了重要的角色。作為一種抗氧化劑,它保護金黃色葡萄球菌免於被白細胞釋放的活性氧殺死。注意一些藥物可以抑制金黃色葡萄球菌製造葡萄球菌黃素並且可以使金黃色葡萄球菌容易被抗生素殺滅。事實上,由於葡萄球菌黃素和人類膽固醇的合成十分相似,所以降低膽固醇的藥物和治療方法也可以阻止細菌製造葡萄球菌黃素。