菏澤市植物檢疫站是菏澤市農業局直屬單位。
1、貫徹《植物檢疫條例》、《山東省農業植物檢疫辦法》及國家、地方各級政府發布的植物檢疫法令和規章制度，向基層幹部和農民宣傳普及檢疫知識；
2、擬訂和實施菏澤市植物檢疫工作計畫；
3、開展植物檢疫性有害生物疫情監測和調查，編制菏澤市檢疫性有害生物分布資料，負責檢疫性有害生物的封鎖、防治和消滅工作；
4、對種子、苗木及其他繁殖材料的繁育基地實施產地檢疫。按照規定承辦應施檢疫的植物、植物產品的調運檢疫手續。對調入的應施檢疫的植物、植物產品，必要時進行復檢。監督和指導引種單位進行消毒處理和隔離試種；
5、監督指導有關部門建立無檢疫性有害生物的種子、苗木繁育基地、生產基地；
6、在車站、倉庫及其他有關場所執行植物檢疫任務。
